Protein–RNA interactions for Protein: Q96MN9

ZNF488, Zinc finger protein 488, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF488Q96MN9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF488Q96MN9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF488Q96MN9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF488Q96MN9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF488Q96MN9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ZNF488Q96MN9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ZNF488Q96MN9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF488Q96MN9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF488Q96MN9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF488Q96MN9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF488Q96MN9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF488Q96MN9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF488Q96MN9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF488Q96MN9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF488Q96MN9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF488Q96MN9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF488Q96MN9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF488Q96MN9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF488Q96MN9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF488Q96MN9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF488Q96MN9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF488Q96MN9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF488Q96MN9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF488Q96MN9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF488Q96MN9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF488Q96MN9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF488Q96MN9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF488Q96MN9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF488Q96MN9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF488Q96MN9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF488Q96MN9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF488Q96MN9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF488Q96MN9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF488Q96MN9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF488Q96MN9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF488Q96MN9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF488Q96MN9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF488Q96MN9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF488Q96MN9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF488Q96MN9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF488Q96MN9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF488Q96MN9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF488Q96MN9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF488Q96MN9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF488Q96MN9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF488Q96MN9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF488Q96MN9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF488Q96MN9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
ZNF488Q96MN9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZNF488Q96MN9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZNF488Q96MN9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF488Q96MN9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF488Q96MN9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF488Q96MN9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF488Q96MN9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF488Q96MN9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF488Q96MN9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF488Q96MN9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF488Q96MN9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF488Q96MN9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF488Q96MN9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF488Q96MN9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF488Q96MN9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF488Q96MN9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF488Q96MN9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF488Q96MN9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF488Q96MN9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF488Q96MN9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF488Q96MN9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF488Q96MN9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF488Q96MN9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF488Q96MN9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF488Q96MN9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF488Q96MN9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF488Q96MN9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF488Q96MN9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF488Q96MN9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF488Q96MN9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF488Q96MN9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF488Q96MN9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF488Q96MN9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF488Q96MN9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF488Q96MN9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF488Q96MN9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF488Q96MN9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF488Q96MN9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF488Q96MN9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF488Q96MN9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF488Q96MN9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF488Q96MN9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF488Q96MN9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ZNF488Q96MN9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
ZNF488Q96MN9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ZNF488Q96MN9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF488Q96MN9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF488Q96MN9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF488Q96MN9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF488Q96MN9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF488Q96MN9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF488Q96MN9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms