Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
C9orf72Q96LT7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
C9orf72Q96LT7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
C9orf72Q96LT7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
C9orf72Q96LT7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
C9orf72Q96LT7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
C9orf72Q96LT7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
C9orf72Q96LT7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
C9orf72Q96LT7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
C9orf72Q96LT7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
C9orf72Q96LT7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
C9orf72Q96LT7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
C9orf72Q96LT7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C9orf72Q96LT7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C9orf72Q96LT7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
C9orf72Q96LT7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C9orf72Q96LT7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
C9orf72Q96LT7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
C9orf72Q96LT7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C9orf72Q96LT7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
C9orf72Q96LT7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
C9orf72Q96LT7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
C9orf72Q96LT7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
C9orf72Q96LT7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
C9orf72Q96LT7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
C9orf72Q96LT7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
C9orf72Q96LT7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
C9orf72Q96LT7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
C9orf72Q96LT7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
C9orf72Q96LT7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
C9orf72Q96LT7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
C9orf72Q96LT7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
C9orf72Q96LT7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
C9orf72Q96LT7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
C9orf72Q96LT7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
C9orf72Q96LT7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
C9orf72Q96LT7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C9orf72Q96LT7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
C9orf72Q96LT7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C9orf72Q96LT7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C9orf72Q96LT7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C9orf72Q96LT7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C9orf72Q96LT7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C9orf72Q96LT7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
C9orf72Q96LT7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
C9orf72Q96LT7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C9orf72Q96LT7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C9orf72Q96LT7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
C9orf72Q96LT7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C9orf72Q96LT7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C9orf72Q96LT7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C9orf72Q96LT7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C9orf72Q96LT7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C9orf72Q96LT7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
C9orf72Q96LT7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C9orf72Q96LT7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C9orf72Q96LT7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
C9orf72Q96LT7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
C9orf72Q96LT7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C9orf72Q96LT7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C9orf72Q96LT7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C9orf72Q96LT7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
C9orf72Q96LT7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
C9orf72Q96LT7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C9orf72Q96LT7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C9orf72Q96LT7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
C9orf72Q96LT7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
C9orf72Q96LT7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
C9orf72Q96LT7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C9orf72Q96LT7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
C9orf72Q96LT7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C9orf72Q96LT7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C9orf72Q96LT7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C9orf72Q96LT7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
C9orf72Q96LT7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C9orf72Q96LT7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C9orf72Q96LT7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C9orf72Q96LT7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
C9orf72Q96LT7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C9orf72Q96LT7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C9orf72Q96LT7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C9orf72Q96LT7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C9orf72Q96LT7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C9orf72Q96LT7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C9orf72Q96LT7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C9orf72Q96LT7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C9orf72Q96LT7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C9orf72Q96LT7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C9orf72Q96LT7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C9orf72Q96LT7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
C9orf72Q96LT7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C9orf72Q96LT7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C9orf72Q96LT7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C9orf72Q96LT7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
C9orf72Q96LT7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C9orf72Q96LT7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C9orf72Q96LT7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C9orf72Q96LT7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C9orf72Q96LT7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C9orf72Q96LT7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms