Protein–RNA interactions for Protein: Q96EF6

FBXO17, F-box only protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO17Q96EF6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FBXO17Q96EF6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FBXO17Q96EF6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FBXO17Q96EF6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FBXO17Q96EF6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FBXO17Q96EF6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FBXO17Q96EF6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FBXO17Q96EF6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.99
FBXO17Q96EF6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FBXO17Q96EF6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FBXO17Q96EF6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FBXO17Q96EF6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FBXO17Q96EF6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FBXO17Q96EF6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FBXO17Q96EF6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FBXO17Q96EF6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FBXO17Q96EF6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FBXO17Q96EF6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FBXO17Q96EF6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
FBXO17Q96EF6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FBXO17Q96EF6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FBXO17Q96EF6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FBXO17Q96EF6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FBXO17Q96EF6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FBXO17Q96EF6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FBXO17Q96EF6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FBXO17Q96EF6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
FBXO17Q96EF6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FBXO17Q96EF6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
FBXO17Q96EF6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FBXO17Q96EF6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FBXO17Q96EF6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FBXO17Q96EF6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FBXO17Q96EF6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FBXO17Q96EF6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
FBXO17Q96EF6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
FBXO17Q96EF6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FBXO17Q96EF6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FBXO17Q96EF6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FBXO17Q96EF6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FBXO17Q96EF6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FBXO17Q96EF6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FBXO17Q96EF6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FBXO17Q96EF6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FBXO17Q96EF6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FBXO17Q96EF6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FBXO17Q96EF6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FBXO17Q96EF6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FBXO17Q96EF6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FBXO17Q96EF6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FBXO17Q96EF6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
FBXO17Q96EF6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FBXO17Q96EF6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FBXO17Q96EF6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FBXO17Q96EF6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FBXO17Q96EF6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FBXO17Q96EF6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
FBXO17Q96EF6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FBXO17Q96EF6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FBXO17Q96EF6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FBXO17Q96EF6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FBXO17Q96EF6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FBXO17Q96EF6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FBXO17Q96EF6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
FBXO17Q96EF6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FBXO17Q96EF6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FBXO17Q96EF6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FBXO17Q96EF6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FBXO17Q96EF6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FBXO17Q96EF6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FBXO17Q96EF6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
FBXO17Q96EF6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FBXO17Q96EF6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FBXO17Q96EF6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FBXO17Q96EF6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FBXO17Q96EF6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FBXO17Q96EF6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FBXO17Q96EF6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FBXO17Q96EF6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FBXO17Q96EF6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
FBXO17Q96EF6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FBXO17Q96EF6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FBXO17Q96EF6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FBXO17Q96EF6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FBXO17Q96EF6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FBXO17Q96EF6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FBXO17Q96EF6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FBXO17Q96EF6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
FBXO17Q96EF6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
FBXO17Q96EF6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FBXO17Q96EF6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FBXO17Q96EF6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
FBXO17Q96EF6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FBXO17Q96EF6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FBXO17Q96EF6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FBXO17Q96EF6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FBXO17Q96EF6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FBXO17Q96EF6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FBXO17Q96EF6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FBXO17Q96EF6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms