Protein–RNA interactions for Protein: Q96DN2

VWCE, von Willebrand factor C and EGF domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 955 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWCEQ96DN2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
VWCEQ96DN2 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
VWCEQ96DN2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
VWCEQ96DN2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
VWCEQ96DN2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
VWCEQ96DN2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
VWCEQ96DN2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
VWCEQ96DN2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
VWCEQ96DN2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
VWCEQ96DN2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
VWCEQ96DN2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
VWCEQ96DN2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
VWCEQ96DN2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
VWCEQ96DN2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
VWCEQ96DN2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
VWCEQ96DN2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
VWCEQ96DN2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
VWCEQ96DN2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
VWCEQ96DN2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
VWCEQ96DN2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
VWCEQ96DN2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
VWCEQ96DN2 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
VWCEQ96DN2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
VWCEQ96DN2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
VWCEQ96DN2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
VWCEQ96DN2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
VWCEQ96DN2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
VWCEQ96DN2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
VWCEQ96DN2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
VWCEQ96DN2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
VWCEQ96DN2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
VWCEQ96DN2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
VWCEQ96DN2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
VWCEQ96DN2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
VWCEQ96DN2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
VWCEQ96DN2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
VWCEQ96DN2 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
VWCEQ96DN2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
VWCEQ96DN2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
VWCEQ96DN2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
VWCEQ96DN2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
VWCEQ96DN2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
VWCEQ96DN2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
VWCEQ96DN2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
VWCEQ96DN2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
VWCEQ96DN2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
VWCEQ96DN2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
VWCEQ96DN2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
VWCEQ96DN2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
VWCEQ96DN2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
VWCEQ96DN2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
VWCEQ96DN2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
VWCEQ96DN2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
VWCEQ96DN2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
VWCEQ96DN2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
VWCEQ96DN2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
VWCEQ96DN2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
VWCEQ96DN2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
VWCEQ96DN2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
VWCEQ96DN2 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
VWCEQ96DN2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
VWCEQ96DN2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
VWCEQ96DN2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
VWCEQ96DN2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
VWCEQ96DN2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
VWCEQ96DN2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
VWCEQ96DN2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
VWCEQ96DN2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
VWCEQ96DN2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
VWCEQ96DN2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
VWCEQ96DN2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
VWCEQ96DN2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
VWCEQ96DN2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
VWCEQ96DN2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
VWCEQ96DN2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
VWCEQ96DN2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
VWCEQ96DN2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
VWCEQ96DN2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
VWCEQ96DN2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
VWCEQ96DN2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
VWCEQ96DN2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
VWCEQ96DN2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
VWCEQ96DN2 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
VWCEQ96DN2 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
VWCEQ96DN2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
VWCEQ96DN2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
VWCEQ96DN2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
VWCEQ96DN2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
VWCEQ96DN2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
VWCEQ96DN2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
VWCEQ96DN2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
VWCEQ96DN2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
VWCEQ96DN2 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
VWCEQ96DN2 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
VWCEQ96DN2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
VWCEQ96DN2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
VWCEQ96DN2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
VWCEQ96DN2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
VWCEQ96DN2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
VWCEQ96DN2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 214.1 ms