Protein–RNA interactions for Protein: Q96CS3

FAF2, FAS-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAF2Q96CS3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FAF2Q96CS3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FAF2Q96CS3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FAF2Q96CS3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FAF2Q96CS3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FAF2Q96CS3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FAF2Q96CS3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FAF2Q96CS3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FAF2Q96CS3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FAF2Q96CS3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FAF2Q96CS3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FAF2Q96CS3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FAF2Q96CS3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FAF2Q96CS3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FAF2Q96CS3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FAF2Q96CS3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FAF2Q96CS3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FAF2Q96CS3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FAF2Q96CS3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FAF2Q96CS3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FAF2Q96CS3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FAF2Q96CS3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FAF2Q96CS3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
FAF2Q96CS3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FAF2Q96CS3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
FAF2Q96CS3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FAF2Q96CS3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
FAF2Q96CS3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FAF2Q96CS3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FAF2Q96CS3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FAF2Q96CS3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FAF2Q96CS3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FAF2Q96CS3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FAF2Q96CS3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FAF2Q96CS3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FAF2Q96CS3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FAF2Q96CS3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FAF2Q96CS3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FAF2Q96CS3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FAF2Q96CS3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FAF2Q96CS3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FAF2Q96CS3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FAF2Q96CS3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FAF2Q96CS3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FAF2Q96CS3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FAF2Q96CS3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FAF2Q96CS3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FAF2Q96CS3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FAF2Q96CS3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
FAF2Q96CS3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FAF2Q96CS3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FAF2Q96CS3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FAF2Q96CS3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FAF2Q96CS3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FAF2Q96CS3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FAF2Q96CS3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FAF2Q96CS3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FAF2Q96CS3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FAF2Q96CS3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FAF2Q96CS3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FAF2Q96CS3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FAF2Q96CS3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FAF2Q96CS3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FAF2Q96CS3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FAF2Q96CS3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FAF2Q96CS3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FAF2Q96CS3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
FAF2Q96CS3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FAF2Q96CS3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
FAF2Q96CS3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FAF2Q96CS3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FAF2Q96CS3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FAF2Q96CS3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FAF2Q96CS3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FAF2Q96CS3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
FAF2Q96CS3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FAF2Q96CS3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FAF2Q96CS3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FAF2Q96CS3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FAF2Q96CS3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FAF2Q96CS3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FAF2Q96CS3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FAF2Q96CS3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
FAF2Q96CS3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FAF2Q96CS3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAF2Q96CS3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAF2Q96CS3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAF2Q96CS3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAF2Q96CS3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAF2Q96CS3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAF2Q96CS3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAF2Q96CS3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAF2Q96CS3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAF2Q96CS3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
FAF2Q96CS3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAF2Q96CS3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAF2Q96CS3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAF2Q96CS3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAF2Q96CS3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAF2Q96CS3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms