Protein–RNA interactions for Protein: Q96CF2

CHMP4C, Charged multivesicular body protein 4c, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4CQ96CF2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CHMP4CQ96CF2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CHMP4CQ96CF2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CHMP4CQ96CF2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CHMP4CQ96CF2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CHMP4CQ96CF2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CHMP4CQ96CF2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CHMP4CQ96CF2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CHMP4CQ96CF2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CHMP4CQ96CF2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CHMP4CQ96CF2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CHMP4CQ96CF2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CHMP4CQ96CF2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CHMP4CQ96CF2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CHMP4CQ96CF2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CHMP4CQ96CF2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CHMP4CQ96CF2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CHMP4CQ96CF2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CHMP4CQ96CF2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CHMP4CQ96CF2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CHMP4CQ96CF2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CHMP4CQ96CF2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CHMP4CQ96CF2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CHMP4CQ96CF2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CHMP4CQ96CF2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CHMP4CQ96CF2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CHMP4CQ96CF2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CHMP4CQ96CF2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CHMP4CQ96CF2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CHMP4CQ96CF2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CHMP4CQ96CF2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CHMP4CQ96CF2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CHMP4CQ96CF2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CHMP4CQ96CF2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CHMP4CQ96CF2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CHMP4CQ96CF2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CHMP4CQ96CF2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CHMP4CQ96CF2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CHMP4CQ96CF2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CHMP4CQ96CF2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CHMP4CQ96CF2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CHMP4CQ96CF2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CHMP4CQ96CF2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CHMP4CQ96CF2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CHMP4CQ96CF2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CHMP4CQ96CF2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CHMP4CQ96CF2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CHMP4CQ96CF2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CHMP4CQ96CF2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CHMP4CQ96CF2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CHMP4CQ96CF2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CHMP4CQ96CF2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CHMP4CQ96CF2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CHMP4CQ96CF2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CHMP4CQ96CF2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CHMP4CQ96CF2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CHMP4CQ96CF2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CHMP4CQ96CF2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CHMP4CQ96CF2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
CHMP4CQ96CF2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CHMP4CQ96CF2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CHMP4CQ96CF2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CHMP4CQ96CF2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CHMP4CQ96CF2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CHMP4CQ96CF2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CHMP4CQ96CF2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CHMP4CQ96CF2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CHMP4CQ96CF2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CHMP4CQ96CF2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CHMP4CQ96CF2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CHMP4CQ96CF2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CHMP4CQ96CF2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CHMP4CQ96CF2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
CHMP4CQ96CF2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CHMP4CQ96CF2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CHMP4CQ96CF2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CHMP4CQ96CF2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CHMP4CQ96CF2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CHMP4CQ96CF2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CHMP4CQ96CF2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CHMP4CQ96CF2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CHMP4CQ96CF2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CHMP4CQ96CF2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CHMP4CQ96CF2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CHMP4CQ96CF2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CHMP4CQ96CF2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CHMP4CQ96CF2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CHMP4CQ96CF2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CHMP4CQ96CF2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CHMP4CQ96CF2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CHMP4CQ96CF2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CHMP4CQ96CF2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CHMP4CQ96CF2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CHMP4CQ96CF2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CHMP4CQ96CF2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CHMP4CQ96CF2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CHMP4CQ96CF2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CHMP4CQ96CF2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CHMP4CQ96CF2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CHMP4CQ96CF2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.7 ms