Protein–RNA interactions for Protein: Q96CD2

PPCDC, Phosphopantothenoylcysteine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPCDCQ96CD2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPCDCQ96CD2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPCDCQ96CD2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPCDCQ96CD2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPCDCQ96CD2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPCDCQ96CD2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPCDCQ96CD2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPCDCQ96CD2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPCDCQ96CD2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPCDCQ96CD2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPCDCQ96CD2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPCDCQ96CD2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPCDCQ96CD2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPCDCQ96CD2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PPCDCQ96CD2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPCDCQ96CD2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPCDCQ96CD2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPCDCQ96CD2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPCDCQ96CD2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PPCDCQ96CD2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPCDCQ96CD2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PPCDCQ96CD2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPCDCQ96CD2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPCDCQ96CD2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPCDCQ96CD2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPCDCQ96CD2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPCDCQ96CD2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPCDCQ96CD2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PPCDCQ96CD2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPCDCQ96CD2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPCDCQ96CD2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPCDCQ96CD2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPCDCQ96CD2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPCDCQ96CD2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPCDCQ96CD2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPCDCQ96CD2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPCDCQ96CD2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPCDCQ96CD2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPCDCQ96CD2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPCDCQ96CD2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPCDCQ96CD2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPCDCQ96CD2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPCDCQ96CD2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPCDCQ96CD2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPCDCQ96CD2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PPCDCQ96CD2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPCDCQ96CD2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPCDCQ96CD2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPCDCQ96CD2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPCDCQ96CD2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPCDCQ96CD2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPCDCQ96CD2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPCDCQ96CD2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPCDCQ96CD2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPCDCQ96CD2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PPCDCQ96CD2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPCDCQ96CD2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPCDCQ96CD2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPCDCQ96CD2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPCDCQ96CD2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPCDCQ96CD2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PPCDCQ96CD2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPCDCQ96CD2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPCDCQ96CD2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PPCDCQ96CD2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPCDCQ96CD2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPCDCQ96CD2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPCDCQ96CD2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPCDCQ96CD2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPCDCQ96CD2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPCDCQ96CD2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PPCDCQ96CD2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPCDCQ96CD2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPCDCQ96CD2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPCDCQ96CD2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PPCDCQ96CD2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPCDCQ96CD2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPCDCQ96CD2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPCDCQ96CD2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPCDCQ96CD2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPCDCQ96CD2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPCDCQ96CD2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPCDCQ96CD2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPCDCQ96CD2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPCDCQ96CD2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPCDCQ96CD2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPCDCQ96CD2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PPCDCQ96CD2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPCDCQ96CD2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PPCDCQ96CD2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PPCDCQ96CD2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PPCDCQ96CD2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PPCDCQ96CD2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPCDCQ96CD2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPCDCQ96CD2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPCDCQ96CD2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPCDCQ96CD2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPCDCQ96CD2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPCDCQ96CD2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPCDCQ96CD2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms