Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAVIN3Q969G5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAVIN3Q969G5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAVIN3Q969G5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAVIN3Q969G5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAVIN3Q969G5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAVIN3Q969G5 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAVIN3Q969G5 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAVIN3Q969G5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAVIN3Q969G5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAVIN3Q969G5 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAVIN3Q969G5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAVIN3Q969G5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAVIN3Q969G5 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAVIN3Q969G5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAVIN3Q969G5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAVIN3Q969G5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAVIN3Q969G5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAVIN3Q969G5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAVIN3Q969G5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAVIN3Q969G5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAVIN3Q969G5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAVIN3Q969G5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAVIN3Q969G5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAVIN3Q969G5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAVIN3Q969G5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAVIN3Q969G5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAVIN3Q969G5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAVIN3Q969G5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAVIN3Q969G5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAVIN3Q969G5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAVIN3Q969G5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAVIN3Q969G5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAVIN3Q969G5 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAVIN3Q969G5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAVIN3Q969G5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAVIN3Q969G5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAVIN3Q969G5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAVIN3Q969G5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAVIN3Q969G5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAVIN3Q969G5 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAVIN3Q969G5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAVIN3Q969G5 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAVIN3Q969G5 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAVIN3Q969G5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAVIN3Q969G5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAVIN3Q969G5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAVIN3Q969G5 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAVIN3Q969G5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CAVIN3Q969G5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAVIN3Q969G5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAVIN3Q969G5 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAVIN3Q969G5 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAVIN3Q969G5 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CAVIN3Q969G5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAVIN3Q969G5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAVIN3Q969G5 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CAVIN3Q969G5 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CAVIN3Q969G5 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CAVIN3Q969G5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAVIN3Q969G5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAVIN3Q969G5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAVIN3Q969G5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAVIN3Q969G5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAVIN3Q969G5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAVIN3Q969G5 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAVIN3Q969G5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CAVIN3Q969G5 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAVIN3Q969G5 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAVIN3Q969G5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAVIN3Q969G5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAVIN3Q969G5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAVIN3Q969G5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAVIN3Q969G5 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAVIN3Q969G5 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAVIN3Q969G5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAVIN3Q969G5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAVIN3Q969G5 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAVIN3Q969G5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAVIN3Q969G5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CAVIN3Q969G5 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAVIN3Q969G5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAVIN3Q969G5 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAVIN3Q969G5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAVIN3Q969G5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAVIN3Q969G5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAVIN3Q969G5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAVIN3Q969G5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAVIN3Q969G5 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAVIN3Q969G5 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAVIN3Q969G5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAVIN3Q969G5 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAVIN3Q969G5 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAVIN3Q969G5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAVIN3Q969G5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAVIN3Q969G5 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAVIN3Q969G5 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAVIN3Q969G5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAVIN3Q969G5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAVIN3Q969G5 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms