Protein–RNA interactions for Protein: Q969F2

NKD2, Protein naked cuticle homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD2Q969F2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NKD2Q969F2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NKD2Q969F2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NKD2Q969F2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NKD2Q969F2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NKD2Q969F2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NKD2Q969F2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NKD2Q969F2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NKD2Q969F2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NKD2Q969F2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NKD2Q969F2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NKD2Q969F2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NKD2Q969F2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NKD2Q969F2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NKD2Q969F2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NKD2Q969F2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NKD2Q969F2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NKD2Q969F2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NKD2Q969F2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NKD2Q969F2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NKD2Q969F2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NKD2Q969F2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NKD2Q969F2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NKD2Q969F2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NKD2Q969F2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
NKD2Q969F2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NKD2Q969F2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NKD2Q969F2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NKD2Q969F2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NKD2Q969F2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NKD2Q969F2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NKD2Q969F2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NKD2Q969F2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NKD2Q969F2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NKD2Q969F2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NKD2Q969F2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NKD2Q969F2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NKD2Q969F2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NKD2Q969F2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NKD2Q969F2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NKD2Q969F2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NKD2Q969F2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NKD2Q969F2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NKD2Q969F2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NKD2Q969F2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NKD2Q969F2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NKD2Q969F2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NKD2Q969F2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NKD2Q969F2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NKD2Q969F2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NKD2Q969F2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NKD2Q969F2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NKD2Q969F2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
NKD2Q969F2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NKD2Q969F2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NKD2Q969F2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NKD2Q969F2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NKD2Q969F2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NKD2Q969F2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NKD2Q969F2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NKD2Q969F2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NKD2Q969F2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NKD2Q969F2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NKD2Q969F2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NKD2Q969F2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NKD2Q969F2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NKD2Q969F2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NKD2Q969F2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NKD2Q969F2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NKD2Q969F2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NKD2Q969F2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NKD2Q969F2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NKD2Q969F2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NKD2Q969F2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NKD2Q969F2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NKD2Q969F2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NKD2Q969F2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NKD2Q969F2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
NKD2Q969F2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NKD2Q969F2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NKD2Q969F2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NKD2Q969F2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NKD2Q969F2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NKD2Q969F2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NKD2Q969F2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NKD2Q969F2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NKD2Q969F2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NKD2Q969F2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NKD2Q969F2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NKD2Q969F2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NKD2Q969F2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NKD2Q969F2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NKD2Q969F2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NKD2Q969F2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NKD2Q969F2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NKD2Q969F2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NKD2Q969F2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NKD2Q969F2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NKD2Q969F2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NKD2Q969F2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms