Protein–RNA interactions for Protein: Q92930

RAB8B, Ras-related protein Rab-8B, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB8BQ92930 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB8BQ92930 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB8BQ92930 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB8BQ92930 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB8BQ92930 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB8BQ92930 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB8BQ92930 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB8BQ92930 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB8BQ92930 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RAB8BQ92930 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB8BQ92930 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB8BQ92930 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB8BQ92930 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB8BQ92930 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB8BQ92930 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB8BQ92930 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB8BQ92930 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB8BQ92930 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB8BQ92930 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB8BQ92930 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB8BQ92930 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB8BQ92930 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB8BQ92930 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB8BQ92930 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB8BQ92930 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB8BQ92930 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB8BQ92930 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB8BQ92930 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB8BQ92930 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB8BQ92930 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB8BQ92930 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB8BQ92930 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB8BQ92930 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB8BQ92930 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB8BQ92930 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB8BQ92930 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB8BQ92930 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB8BQ92930 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB8BQ92930 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB8BQ92930 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB8BQ92930 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB8BQ92930 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB8BQ92930 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB8BQ92930 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB8BQ92930 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB8BQ92930 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB8BQ92930 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB8BQ92930 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB8BQ92930 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB8BQ92930 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB8BQ92930 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB8BQ92930 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB8BQ92930 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB8BQ92930 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB8BQ92930 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB8BQ92930 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB8BQ92930 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB8BQ92930 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RAB8BQ92930 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
RAB8BQ92930 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RAB8BQ92930 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RAB8BQ92930 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB8BQ92930 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB8BQ92930 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB8BQ92930 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB8BQ92930 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB8BQ92930 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB8BQ92930 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB8BQ92930 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB8BQ92930 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB8BQ92930 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB8BQ92930 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB8BQ92930 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB8BQ92930 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB8BQ92930 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB8BQ92930 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB8BQ92930 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB8BQ92930 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB8BQ92930 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB8BQ92930 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB8BQ92930 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB8BQ92930 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB8BQ92930 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB8BQ92930 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB8BQ92930 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB8BQ92930 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB8BQ92930 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB8BQ92930 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB8BQ92930 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB8BQ92930 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB8BQ92930 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB8BQ92930 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB8BQ92930 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB8BQ92930 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB8BQ92930 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RAB8BQ92930 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RAB8BQ92930 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB8BQ92930 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB8BQ92930 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB8BQ92930 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms