Protein–RNA interactions for Protein: Q92786

PROX1, Prospero homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 737 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROX1Q92786 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PROX1Q92786 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PROX1Q92786 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PROX1Q92786 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PROX1Q92786 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PROX1Q92786 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PROX1Q92786 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PROX1Q92786 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PROX1Q92786 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PROX1Q92786 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PROX1Q92786 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PROX1Q92786 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PROX1Q92786 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PROX1Q92786 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PROX1Q92786 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PROX1Q92786 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PROX1Q92786 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PROX1Q92786 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PROX1Q92786 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PROX1Q92786 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PROX1Q92786 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PROX1Q92786 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PROX1Q92786 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PROX1Q92786 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PROX1Q92786 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PROX1Q92786 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PROX1Q92786 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PROX1Q92786 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PROX1Q92786 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PROX1Q92786 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PROX1Q92786 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PROX1Q92786 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PROX1Q92786 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PROX1Q92786 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PROX1Q92786 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PROX1Q92786 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PROX1Q92786 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PROX1Q92786 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PROX1Q92786 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PROX1Q92786 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PROX1Q92786 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PROX1Q92786 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PROX1Q92786 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PROX1Q92786 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PROX1Q92786 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PROX1Q92786 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PROX1Q92786 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PROX1Q92786 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PROX1Q92786 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PROX1Q92786 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PROX1Q92786 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PROX1Q92786 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PROX1Q92786 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PROX1Q92786 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PROX1Q92786 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PROX1Q92786 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PROX1Q92786 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PROX1Q92786 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PROX1Q92786 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PROX1Q92786 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PROX1Q92786 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PROX1Q92786 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PROX1Q92786 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PROX1Q92786 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PROX1Q92786 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PROX1Q92786 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PROX1Q92786 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PROX1Q92786 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PROX1Q92786 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PROX1Q92786 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PROX1Q92786 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PROX1Q92786 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PROX1Q92786 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PROX1Q92786 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PROX1Q92786 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PROX1Q92786 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PROX1Q92786 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PROX1Q92786 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PROX1Q92786 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PROX1Q92786 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PROX1Q92786 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PROX1Q92786 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PROX1Q92786 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PROX1Q92786 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PROX1Q92786 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PROX1Q92786 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PROX1Q92786 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PROX1Q92786 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PROX1Q92786 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PROX1Q92786 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PROX1Q92786 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PROX1Q92786 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PROX1Q92786 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PROX1Q92786 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PROX1Q92786 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PROX1Q92786 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PROX1Q92786 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PROX1Q92786 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PROX1Q92786 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PROX1Q92786 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms