Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF40

FNIP1, Folliculin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNIP1Q8TF40 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FNIP1Q8TF40 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FNIP1Q8TF40 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FNIP1Q8TF40 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FNIP1Q8TF40 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FNIP1Q8TF40 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FNIP1Q8TF40 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
FNIP1Q8TF40 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FNIP1Q8TF40 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FNIP1Q8TF40 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FNIP1Q8TF40 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FNIP1Q8TF40 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FNIP1Q8TF40 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FNIP1Q8TF40 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FNIP1Q8TF40 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FNIP1Q8TF40 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FNIP1Q8TF40 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FNIP1Q8TF40 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FNIP1Q8TF40 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FNIP1Q8TF40 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FNIP1Q8TF40 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FNIP1Q8TF40 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
FNIP1Q8TF40 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FNIP1Q8TF40 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FNIP1Q8TF40 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
FNIP1Q8TF40 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FNIP1Q8TF40 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FNIP1Q8TF40 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
FNIP1Q8TF40 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FNIP1Q8TF40 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FNIP1Q8TF40 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
FNIP1Q8TF40 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FNIP1Q8TF40 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FNIP1Q8TF40 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
FNIP1Q8TF40 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FNIP1Q8TF40 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
FNIP1Q8TF40 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FNIP1Q8TF40 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FNIP1Q8TF40 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FNIP1Q8TF40 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FNIP1Q8TF40 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FNIP1Q8TF40 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FNIP1Q8TF40 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FNIP1Q8TF40 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FNIP1Q8TF40 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FNIP1Q8TF40 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FNIP1Q8TF40 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FNIP1Q8TF40 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FNIP1Q8TF40 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FNIP1Q8TF40 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FNIP1Q8TF40 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FNIP1Q8TF40 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FNIP1Q8TF40 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
FNIP1Q8TF40 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FNIP1Q8TF40 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FNIP1Q8TF40 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FNIP1Q8TF40 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
FNIP1Q8TF40 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
FNIP1Q8TF40 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FNIP1Q8TF40 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FNIP1Q8TF40 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FNIP1Q8TF40 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FNIP1Q8TF40 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FNIP1Q8TF40 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FNIP1Q8TF40 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FNIP1Q8TF40 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FNIP1Q8TF40 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FNIP1Q8TF40 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FNIP1Q8TF40 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FNIP1Q8TF40 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FNIP1Q8TF40 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FNIP1Q8TF40 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FNIP1Q8TF40 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FNIP1Q8TF40 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FNIP1Q8TF40 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FNIP1Q8TF40 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FNIP1Q8TF40 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FNIP1Q8TF40 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FNIP1Q8TF40 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FNIP1Q8TF40 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FNIP1Q8TF40 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FNIP1Q8TF40 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FNIP1Q8TF40 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FNIP1Q8TF40 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FNIP1Q8TF40 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FNIP1Q8TF40 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FNIP1Q8TF40 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FNIP1Q8TF40 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FNIP1Q8TF40 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FNIP1Q8TF40 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FNIP1Q8TF40 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FNIP1Q8TF40 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FNIP1Q8TF40 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FNIP1Q8TF40 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FNIP1Q8TF40 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FNIP1Q8TF40 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
FNIP1Q8TF40 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FNIP1Q8TF40 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FNIP1Q8TF40 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FNIP1Q8TF40 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.6 ms