Protein–RNA interactions for Protein: Q8TD06

AGR3, Anterior gradient protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGR3Q8TD06 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AGR3Q8TD06 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AGR3Q8TD06 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AGR3Q8TD06 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AGR3Q8TD06 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AGR3Q8TD06 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
AGR3Q8TD06 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AGR3Q8TD06 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
AGR3Q8TD06 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AGR3Q8TD06 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AGR3Q8TD06 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AGR3Q8TD06 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AGR3Q8TD06 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AGR3Q8TD06 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AGR3Q8TD06 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AGR3Q8TD06 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AGR3Q8TD06 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AGR3Q8TD06 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AGR3Q8TD06 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AGR3Q8TD06 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
AGR3Q8TD06 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AGR3Q8TD06 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AGR3Q8TD06 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AGR3Q8TD06 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AGR3Q8TD06 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AGR3Q8TD06 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AGR3Q8TD06 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AGR3Q8TD06 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AGR3Q8TD06 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AGR3Q8TD06 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AGR3Q8TD06 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AGR3Q8TD06 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AGR3Q8TD06 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AGR3Q8TD06 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AGR3Q8TD06 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AGR3Q8TD06 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AGR3Q8TD06 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AGR3Q8TD06 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AGR3Q8TD06 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AGR3Q8TD06 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AGR3Q8TD06 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AGR3Q8TD06 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AGR3Q8TD06 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AGR3Q8TD06 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AGR3Q8TD06 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AGR3Q8TD06 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AGR3Q8TD06 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
AGR3Q8TD06 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
AGR3Q8TD06 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
AGR3Q8TD06 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AGR3Q8TD06 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AGR3Q8TD06 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
AGR3Q8TD06 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AGR3Q8TD06 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AGR3Q8TD06 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AGR3Q8TD06 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AGR3Q8TD06 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AGR3Q8TD06 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AGR3Q8TD06 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AGR3Q8TD06 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AGR3Q8TD06 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AGR3Q8TD06 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AGR3Q8TD06 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AGR3Q8TD06 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AGR3Q8TD06 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AGR3Q8TD06 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AGR3Q8TD06 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AGR3Q8TD06 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AGR3Q8TD06 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AGR3Q8TD06 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AGR3Q8TD06 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
AGR3Q8TD06 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
AGR3Q8TD06 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
AGR3Q8TD06 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AGR3Q8TD06 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
AGR3Q8TD06 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
AGR3Q8TD06 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AGR3Q8TD06 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AGR3Q8TD06 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
AGR3Q8TD06 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AGR3Q8TD06 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AGR3Q8TD06 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AGR3Q8TD06 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AGR3Q8TD06 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AGR3Q8TD06 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AGR3Q8TD06 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AGR3Q8TD06 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AGR3Q8TD06 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AGR3Q8TD06 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AGR3Q8TD06 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AGR3Q8TD06 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AGR3Q8TD06 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AGR3Q8TD06 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AGR3Q8TD06 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AGR3Q8TD06 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AGR3Q8TD06 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AGR3Q8TD06 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AGR3Q8TD06 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AGR3Q8TD06 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
AGR3Q8TD06 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms