Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH9

ATL2, Atlastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL2Q8NHH9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATL2Q8NHH9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
ATL2Q8NHH9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ATL2Q8NHH9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATL2Q8NHH9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
ATL2Q8NHH9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATL2Q8NHH9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATL2Q8NHH9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ATL2Q8NHH9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATL2Q8NHH9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ATL2Q8NHH9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ATL2Q8NHH9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ATL2Q8NHH9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATL2Q8NHH9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATL2Q8NHH9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATL2Q8NHH9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATL2Q8NHH9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ATL2Q8NHH9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATL2Q8NHH9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATL2Q8NHH9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATL2Q8NHH9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATL2Q8NHH9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATL2Q8NHH9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ATL2Q8NHH9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATL2Q8NHH9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATL2Q8NHH9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATL2Q8NHH9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATL2Q8NHH9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATL2Q8NHH9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATL2Q8NHH9 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATL2Q8NHH9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATL2Q8NHH9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATL2Q8NHH9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATL2Q8NHH9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATL2Q8NHH9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATL2Q8NHH9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATL2Q8NHH9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATL2Q8NHH9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATL2Q8NHH9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATL2Q8NHH9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATL2Q8NHH9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATL2Q8NHH9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATL2Q8NHH9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATL2Q8NHH9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATL2Q8NHH9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATL2Q8NHH9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATL2Q8NHH9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATL2Q8NHH9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATL2Q8NHH9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATL2Q8NHH9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATL2Q8NHH9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATL2Q8NHH9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATL2Q8NHH9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATL2Q8NHH9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATL2Q8NHH9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATL2Q8NHH9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATL2Q8NHH9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATL2Q8NHH9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATL2Q8NHH9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATL2Q8NHH9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATL2Q8NHH9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATL2Q8NHH9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ATL2Q8NHH9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATL2Q8NHH9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATL2Q8NHH9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATL2Q8NHH9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
ATL2Q8NHH9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATL2Q8NHH9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATL2Q8NHH9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATL2Q8NHH9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATL2Q8NHH9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATL2Q8NHH9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATL2Q8NHH9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATL2Q8NHH9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ATL2Q8NHH9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATL2Q8NHH9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATL2Q8NHH9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATL2Q8NHH9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATL2Q8NHH9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATL2Q8NHH9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATL2Q8NHH9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATL2Q8NHH9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATL2Q8NHH9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATL2Q8NHH9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATL2Q8NHH9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATL2Q8NHH9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATL2Q8NHH9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATL2Q8NHH9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATL2Q8NHH9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATL2Q8NHH9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATL2Q8NHH9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATL2Q8NHH9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATL2Q8NHH9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATL2Q8NHH9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATL2Q8NHH9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATL2Q8NHH9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATL2Q8NHH9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATL2Q8NHH9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATL2Q8NHH9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATL2Q8NHH9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 173.1 ms