Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHG7

SVIP, Small VCP/p97-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVIPQ8NHG7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SVIPQ8NHG7 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SVIPQ8NHG7 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SVIPQ8NHG7 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SVIPQ8NHG7 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVIPQ8NHG7 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVIPQ8NHG7 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVIPQ8NHG7 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVIPQ8NHG7 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVIPQ8NHG7 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVIPQ8NHG7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVIPQ8NHG7 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVIPQ8NHG7 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVIPQ8NHG7 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVIPQ8NHG7 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVIPQ8NHG7 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVIPQ8NHG7 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVIPQ8NHG7 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SVIPQ8NHG7 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SVIPQ8NHG7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SVIPQ8NHG7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SVIPQ8NHG7 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SVIPQ8NHG7 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SVIPQ8NHG7 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SVIPQ8NHG7 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SVIPQ8NHG7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SVIPQ8NHG7 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SVIPQ8NHG7 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SVIPQ8NHG7 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SVIPQ8NHG7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SVIPQ8NHG7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SVIPQ8NHG7 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SVIPQ8NHG7 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SVIPQ8NHG7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SVIPQ8NHG7 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SVIPQ8NHG7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SVIPQ8NHG7 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SVIPQ8NHG7 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SVIPQ8NHG7 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SVIPQ8NHG7 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SVIPQ8NHG7 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SVIPQ8NHG7 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SVIPQ8NHG7 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SVIPQ8NHG7 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SVIPQ8NHG7 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SVIPQ8NHG7 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SVIPQ8NHG7 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SVIPQ8NHG7 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SVIPQ8NHG7 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SVIPQ8NHG7 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SVIPQ8NHG7 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SVIPQ8NHG7 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SVIPQ8NHG7 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SVIPQ8NHG7 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SVIPQ8NHG7 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SVIPQ8NHG7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SVIPQ8NHG7 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SVIPQ8NHG7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SVIPQ8NHG7 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SVIPQ8NHG7 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SVIPQ8NHG7 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SVIPQ8NHG7 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SVIPQ8NHG7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SVIPQ8NHG7 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SVIPQ8NHG7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SVIPQ8NHG7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SVIPQ8NHG7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SVIPQ8NHG7 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SVIPQ8NHG7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SVIPQ8NHG7 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SVIPQ8NHG7 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SVIPQ8NHG7 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SVIPQ8NHG7 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SVIPQ8NHG7 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SVIPQ8NHG7 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SVIPQ8NHG7 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SVIPQ8NHG7 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SVIPQ8NHG7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SVIPQ8NHG7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SVIPQ8NHG7 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SVIPQ8NHG7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SVIPQ8NHG7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SVIPQ8NHG7 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SVIPQ8NHG7 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SVIPQ8NHG7 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SVIPQ8NHG7 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SVIPQ8NHG7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SVIPQ8NHG7 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SVIPQ8NHG7 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SVIPQ8NHG7 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SVIPQ8NHG7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SVIPQ8NHG7 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SVIPQ8NHG7 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SVIPQ8NHG7 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SVIPQ8NHG7 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SVIPQ8NHG7 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SVIPQ8NHG7 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SVIPQ8NHG7 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SVIPQ8NHG7 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SVIPQ8NHG7 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms