Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE22

SETD9, SET domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD9Q8NE22 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SETD9Q8NE22 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SETD9Q8NE22 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SETD9Q8NE22 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SETD9Q8NE22 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SETD9Q8NE22 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SETD9Q8NE22 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SETD9Q8NE22 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SETD9Q8NE22 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SETD9Q8NE22 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SETD9Q8NE22 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SETD9Q8NE22 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SETD9Q8NE22 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SETD9Q8NE22 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SETD9Q8NE22 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SETD9Q8NE22 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SETD9Q8NE22 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SETD9Q8NE22 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SETD9Q8NE22 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SETD9Q8NE22 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SETD9Q8NE22 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SETD9Q8NE22 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SETD9Q8NE22 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SETD9Q8NE22 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SETD9Q8NE22 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SETD9Q8NE22 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SETD9Q8NE22 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SETD9Q8NE22 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SETD9Q8NE22 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SETD9Q8NE22 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SETD9Q8NE22 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SETD9Q8NE22 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SETD9Q8NE22 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
SETD9Q8NE22 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SETD9Q8NE22 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SETD9Q8NE22 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SETD9Q8NE22 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SETD9Q8NE22 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SETD9Q8NE22 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SETD9Q8NE22 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SETD9Q8NE22 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SETD9Q8NE22 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SETD9Q8NE22 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SETD9Q8NE22 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SETD9Q8NE22 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SETD9Q8NE22 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SETD9Q8NE22 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SETD9Q8NE22 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SETD9Q8NE22 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SETD9Q8NE22 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SETD9Q8NE22 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SETD9Q8NE22 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SETD9Q8NE22 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SETD9Q8NE22 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SETD9Q8NE22 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SETD9Q8NE22 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SETD9Q8NE22 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SETD9Q8NE22 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SETD9Q8NE22 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SETD9Q8NE22 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SETD9Q8NE22 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SETD9Q8NE22 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SETD9Q8NE22 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SETD9Q8NE22 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SETD9Q8NE22 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SETD9Q8NE22 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SETD9Q8NE22 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SETD9Q8NE22 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SETD9Q8NE22 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SETD9Q8NE22 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SETD9Q8NE22 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SETD9Q8NE22 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SETD9Q8NE22 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SETD9Q8NE22 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SETD9Q8NE22 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SETD9Q8NE22 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SETD9Q8NE22 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SETD9Q8NE22 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SETD9Q8NE22 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SETD9Q8NE22 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SETD9Q8NE22 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SETD9Q8NE22 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SETD9Q8NE22 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SETD9Q8NE22 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SETD9Q8NE22 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SETD9Q8NE22 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SETD9Q8NE22 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SETD9Q8NE22 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SETD9Q8NE22 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SETD9Q8NE22 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SETD9Q8NE22 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SETD9Q8NE22 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SETD9Q8NE22 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SETD9Q8NE22 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SETD9Q8NE22 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SETD9Q8NE22 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SETD9Q8NE22 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SETD9Q8NE22 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SETD9Q8NE22 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SETD9Q8NE22 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.5 ms