Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBN3

TMEM87A, Transmembrane protein 87A, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM87AQ8NBN3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMEM87AQ8NBN3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMEM87AQ8NBN3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMEM87AQ8NBN3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMEM87AQ8NBN3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMEM87AQ8NBN3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMEM87AQ8NBN3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMEM87AQ8NBN3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMEM87AQ8NBN3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TMEM87AQ8NBN3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TMEM87AQ8NBN3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TMEM87AQ8NBN3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TMEM87AQ8NBN3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TMEM87AQ8NBN3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TMEM87AQ8NBN3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TMEM87AQ8NBN3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TMEM87AQ8NBN3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TMEM87AQ8NBN3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TMEM87AQ8NBN3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TMEM87AQ8NBN3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TMEM87AQ8NBN3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TMEM87AQ8NBN3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TMEM87AQ8NBN3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TMEM87AQ8NBN3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TMEM87AQ8NBN3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TMEM87AQ8NBN3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TMEM87AQ8NBN3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
TMEM87AQ8NBN3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TMEM87AQ8NBN3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TMEM87AQ8NBN3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TMEM87AQ8NBN3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TMEM87AQ8NBN3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TMEM87AQ8NBN3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TMEM87AQ8NBN3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TMEM87AQ8NBN3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TMEM87AQ8NBN3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TMEM87AQ8NBN3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TMEM87AQ8NBN3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TMEM87AQ8NBN3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TMEM87AQ8NBN3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TMEM87AQ8NBN3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TMEM87AQ8NBN3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TMEM87AQ8NBN3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TMEM87AQ8NBN3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TMEM87AQ8NBN3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TMEM87AQ8NBN3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TMEM87AQ8NBN3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TMEM87AQ8NBN3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TMEM87AQ8NBN3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TMEM87AQ8NBN3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TMEM87AQ8NBN3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TMEM87AQ8NBN3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TMEM87AQ8NBN3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TMEM87AQ8NBN3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TMEM87AQ8NBN3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TMEM87AQ8NBN3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TMEM87AQ8NBN3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
TMEM87AQ8NBN3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TMEM87AQ8NBN3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TMEM87AQ8NBN3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TMEM87AQ8NBN3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
TMEM87AQ8NBN3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TMEM87AQ8NBN3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
TMEM87AQ8NBN3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TMEM87AQ8NBN3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TMEM87AQ8NBN3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TMEM87AQ8NBN3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TMEM87AQ8NBN3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TMEM87AQ8NBN3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TMEM87AQ8NBN3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TMEM87AQ8NBN3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TMEM87AQ8NBN3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TMEM87AQ8NBN3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TMEM87AQ8NBN3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TMEM87AQ8NBN3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TMEM87AQ8NBN3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMEM87AQ8NBN3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMEM87AQ8NBN3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMEM87AQ8NBN3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMEM87AQ8NBN3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMEM87AQ8NBN3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMEM87AQ8NBN3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMEM87AQ8NBN3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMEM87AQ8NBN3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMEM87AQ8NBN3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMEM87AQ8NBN3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMEM87AQ8NBN3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMEM87AQ8NBN3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TMEM87AQ8NBN3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TMEM87AQ8NBN3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TMEM87AQ8NBN3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TMEM87AQ8NBN3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TMEM87AQ8NBN3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TMEM87AQ8NBN3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TMEM87AQ8NBN3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TMEM87AQ8NBN3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TMEM87AQ8NBN3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TMEM87AQ8NBN3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TMEM87AQ8NBN3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TMEM87AQ8NBN3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms