Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB12

SMYD1, Histone-lysine N-methyltransferase SMYD1, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD1Q8NB12 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMYD1Q8NB12 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMYD1Q8NB12 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMYD1Q8NB12 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMYD1Q8NB12 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SMYD1Q8NB12 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMYD1Q8NB12 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMYD1Q8NB12 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMYD1Q8NB12 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMYD1Q8NB12 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMYD1Q8NB12 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMYD1Q8NB12 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMYD1Q8NB12 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMYD1Q8NB12 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SMYD1Q8NB12 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMYD1Q8NB12 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMYD1Q8NB12 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMYD1Q8NB12 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SMYD1Q8NB12 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMYD1Q8NB12 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMYD1Q8NB12 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMYD1Q8NB12 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMYD1Q8NB12 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMYD1Q8NB12 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMYD1Q8NB12 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMYD1Q8NB12 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMYD1Q8NB12 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMYD1Q8NB12 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SMYD1Q8NB12 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMYD1Q8NB12 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMYD1Q8NB12 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMYD1Q8NB12 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMYD1Q8NB12 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMYD1Q8NB12 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMYD1Q8NB12 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMYD1Q8NB12 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SMYD1Q8NB12 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMYD1Q8NB12 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMYD1Q8NB12 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMYD1Q8NB12 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMYD1Q8NB12 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMYD1Q8NB12 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMYD1Q8NB12 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMYD1Q8NB12 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMYD1Q8NB12 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMYD1Q8NB12 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMYD1Q8NB12 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMYD1Q8NB12 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMYD1Q8NB12 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMYD1Q8NB12 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMYD1Q8NB12 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMYD1Q8NB12 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMYD1Q8NB12 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMYD1Q8NB12 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMYD1Q8NB12 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMYD1Q8NB12 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMYD1Q8NB12 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
SMYD1Q8NB12 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SMYD1Q8NB12 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMYD1Q8NB12 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMYD1Q8NB12 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMYD1Q8NB12 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMYD1Q8NB12 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMYD1Q8NB12 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMYD1Q8NB12 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMYD1Q8NB12 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMYD1Q8NB12 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMYD1Q8NB12 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMYD1Q8NB12 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMYD1Q8NB12 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SMYD1Q8NB12 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMYD1Q8NB12 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMYD1Q8NB12 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMYD1Q8NB12 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMYD1Q8NB12 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMYD1Q8NB12 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMYD1Q8NB12 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMYD1Q8NB12 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMYD1Q8NB12 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SMYD1Q8NB12 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMYD1Q8NB12 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMYD1Q8NB12 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMYD1Q8NB12 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMYD1Q8NB12 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMYD1Q8NB12 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMYD1Q8NB12 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMYD1Q8NB12 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMYD1Q8NB12 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMYD1Q8NB12 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMYD1Q8NB12 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMYD1Q8NB12 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMYD1Q8NB12 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SMYD1Q8NB12 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMYD1Q8NB12 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMYD1Q8NB12 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMYD1Q8NB12 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMYD1Q8NB12 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMYD1Q8NB12 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMYD1Q8NB12 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMYD1Q8NB12 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms