Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYT3

CCDC170, Coiled-coil domain-containing protein 170, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC170Q8IYT3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC170Q8IYT3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC170Q8IYT3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC170Q8IYT3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC170Q8IYT3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC170Q8IYT3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
CCDC170Q8IYT3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC170Q8IYT3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC170Q8IYT3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC170Q8IYT3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC170Q8IYT3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC170Q8IYT3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC170Q8IYT3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC170Q8IYT3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC170Q8IYT3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC170Q8IYT3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC170Q8IYT3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC170Q8IYT3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC170Q8IYT3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC170Q8IYT3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC170Q8IYT3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC170Q8IYT3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC170Q8IYT3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC170Q8IYT3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC170Q8IYT3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC170Q8IYT3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC170Q8IYT3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC170Q8IYT3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC170Q8IYT3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC170Q8IYT3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC170Q8IYT3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC170Q8IYT3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC170Q8IYT3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC170Q8IYT3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC170Q8IYT3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC170Q8IYT3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC170Q8IYT3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC170Q8IYT3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC170Q8IYT3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC170Q8IYT3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC170Q8IYT3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC170Q8IYT3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC170Q8IYT3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC170Q8IYT3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC170Q8IYT3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC170Q8IYT3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC170Q8IYT3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC170Q8IYT3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC170Q8IYT3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC170Q8IYT3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC170Q8IYT3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC170Q8IYT3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC170Q8IYT3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC170Q8IYT3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC170Q8IYT3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC170Q8IYT3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC170Q8IYT3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC170Q8IYT3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC170Q8IYT3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC170Q8IYT3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC170Q8IYT3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC170Q8IYT3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC170Q8IYT3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC170Q8IYT3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC170Q8IYT3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC170Q8IYT3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC170Q8IYT3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC170Q8IYT3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC170Q8IYT3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC170Q8IYT3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC170Q8IYT3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC170Q8IYT3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC170Q8IYT3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC170Q8IYT3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC170Q8IYT3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC170Q8IYT3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC170Q8IYT3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC170Q8IYT3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC170Q8IYT3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC170Q8IYT3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC170Q8IYT3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC170Q8IYT3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC170Q8IYT3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC170Q8IYT3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC170Q8IYT3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC170Q8IYT3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC170Q8IYT3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC170Q8IYT3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC170Q8IYT3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC170Q8IYT3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC170Q8IYT3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC170Q8IYT3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC170Q8IYT3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC170Q8IYT3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC170Q8IYT3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC170Q8IYT3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC170Q8IYT3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC170Q8IYT3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC170Q8IYT3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC170Q8IYT3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms