Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYR2

SMYD4, SET and MYND domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD4Q8IYR2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMYD4Q8IYR2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMYD4Q8IYR2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMYD4Q8IYR2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMYD4Q8IYR2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMYD4Q8IYR2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMYD4Q8IYR2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMYD4Q8IYR2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMYD4Q8IYR2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMYD4Q8IYR2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMYD4Q8IYR2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMYD4Q8IYR2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMYD4Q8IYR2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SMYD4Q8IYR2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SMYD4Q8IYR2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SMYD4Q8IYR2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SMYD4Q8IYR2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SMYD4Q8IYR2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SMYD4Q8IYR2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SMYD4Q8IYR2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SMYD4Q8IYR2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SMYD4Q8IYR2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SMYD4Q8IYR2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SMYD4Q8IYR2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SMYD4Q8IYR2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SMYD4Q8IYR2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SMYD4Q8IYR2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SMYD4Q8IYR2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SMYD4Q8IYR2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SMYD4Q8IYR2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
SMYD4Q8IYR2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SMYD4Q8IYR2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SMYD4Q8IYR2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SMYD4Q8IYR2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SMYD4Q8IYR2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SMYD4Q8IYR2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SMYD4Q8IYR2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SMYD4Q8IYR2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SMYD4Q8IYR2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SMYD4Q8IYR2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SMYD4Q8IYR2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMYD4Q8IYR2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMYD4Q8IYR2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
SMYD4Q8IYR2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMYD4Q8IYR2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
SMYD4Q8IYR2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMYD4Q8IYR2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMYD4Q8IYR2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SMYD4Q8IYR2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SMYD4Q8IYR2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SMYD4Q8IYR2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SMYD4Q8IYR2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SMYD4Q8IYR2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMYD4Q8IYR2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMYD4Q8IYR2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMYD4Q8IYR2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMYD4Q8IYR2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMYD4Q8IYR2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMYD4Q8IYR2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMYD4Q8IYR2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMYD4Q8IYR2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMYD4Q8IYR2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMYD4Q8IYR2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMYD4Q8IYR2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
SMYD4Q8IYR2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SMYD4Q8IYR2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SMYD4Q8IYR2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SMYD4Q8IYR2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SMYD4Q8IYR2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SMYD4Q8IYR2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SMYD4Q8IYR2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SMYD4Q8IYR2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SMYD4Q8IYR2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SMYD4Q8IYR2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SMYD4Q8IYR2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SMYD4Q8IYR2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SMYD4Q8IYR2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SMYD4Q8IYR2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
SMYD4Q8IYR2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
SMYD4Q8IYR2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SMYD4Q8IYR2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SMYD4Q8IYR2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SMYD4Q8IYR2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SMYD4Q8IYR2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SMYD4Q8IYR2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SMYD4Q8IYR2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SMYD4Q8IYR2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SMYD4Q8IYR2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SMYD4Q8IYR2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SMYD4Q8IYR2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SMYD4Q8IYR2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SMYD4Q8IYR2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SMYD4Q8IYR2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SMYD4Q8IYR2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SMYD4Q8IYR2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SMYD4Q8IYR2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SMYD4Q8IYR2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SMYD4Q8IYR2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SMYD4Q8IYR2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SMYD4Q8IYR2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms