Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVD9

NUDCD3, NudC domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCD3Q8IVD9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUDCD3Q8IVD9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUDCD3Q8IVD9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUDCD3Q8IVD9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUDCD3Q8IVD9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUDCD3Q8IVD9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUDCD3Q8IVD9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUDCD3Q8IVD9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NUDCD3Q8IVD9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUDCD3Q8IVD9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUDCD3Q8IVD9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUDCD3Q8IVD9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUDCD3Q8IVD9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUDCD3Q8IVD9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUDCD3Q8IVD9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUDCD3Q8IVD9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUDCD3Q8IVD9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUDCD3Q8IVD9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUDCD3Q8IVD9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
NUDCD3Q8IVD9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NUDCD3Q8IVD9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUDCD3Q8IVD9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUDCD3Q8IVD9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
NUDCD3Q8IVD9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUDCD3Q8IVD9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
NUDCD3Q8IVD9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
NUDCD3Q8IVD9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NUDCD3Q8IVD9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NUDCD3Q8IVD9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NUDCD3Q8IVD9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NUDCD3Q8IVD9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NUDCD3Q8IVD9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NUDCD3Q8IVD9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NUDCD3Q8IVD9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NUDCD3Q8IVD9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUDCD3Q8IVD9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUDCD3Q8IVD9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUDCD3Q8IVD9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NUDCD3Q8IVD9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUDCD3Q8IVD9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUDCD3Q8IVD9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NUDCD3Q8IVD9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUDCD3Q8IVD9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUDCD3Q8IVD9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUDCD3Q8IVD9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUDCD3Q8IVD9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUDCD3Q8IVD9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUDCD3Q8IVD9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NUDCD3Q8IVD9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUDCD3Q8IVD9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUDCD3Q8IVD9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUDCD3Q8IVD9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUDCD3Q8IVD9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUDCD3Q8IVD9 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUDCD3Q8IVD9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUDCD3Q8IVD9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUDCD3Q8IVD9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUDCD3Q8IVD9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUDCD3Q8IVD9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NUDCD3Q8IVD9 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NUDCD3Q8IVD9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NUDCD3Q8IVD9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NUDCD3Q8IVD9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NUDCD3Q8IVD9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NUDCD3Q8IVD9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NUDCD3Q8IVD9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NUDCD3Q8IVD9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NUDCD3Q8IVD9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NUDCD3Q8IVD9 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
NUDCD3Q8IVD9 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
NUDCD3Q8IVD9 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
NUDCD3Q8IVD9 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
NUDCD3Q8IVD9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
NUDCD3Q8IVD9 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
NUDCD3Q8IVD9 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
NUDCD3Q8IVD9 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
NUDCD3Q8IVD9 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
NUDCD3Q8IVD9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
NUDCD3Q8IVD9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NUDCD3Q8IVD9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NUDCD3Q8IVD9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NUDCD3Q8IVD9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NUDCD3Q8IVD9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NUDCD3Q8IVD9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUDCD3Q8IVD9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUDCD3Q8IVD9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUDCD3Q8IVD9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUDCD3Q8IVD9 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUDCD3Q8IVD9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUDCD3Q8IVD9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUDCD3Q8IVD9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUDCD3Q8IVD9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUDCD3Q8IVD9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUDCD3Q8IVD9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUDCD3Q8IVD9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUDCD3Q8IVD9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUDCD3Q8IVD9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUDCD3Q8IVD9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUDCD3Q8IVD9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUDCD3Q8IVD9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms