Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV48

ERI1, 3'-5' exoribonuclease 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERI1Q8IV48 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERI1Q8IV48 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERI1Q8IV48 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ERI1Q8IV48 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERI1Q8IV48 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERI1Q8IV48 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERI1Q8IV48 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERI1Q8IV48 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERI1Q8IV48 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERI1Q8IV48 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERI1Q8IV48 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERI1Q8IV48 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERI1Q8IV48 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERI1Q8IV48 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ERI1Q8IV48 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERI1Q8IV48 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERI1Q8IV48 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERI1Q8IV48 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERI1Q8IV48 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERI1Q8IV48 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERI1Q8IV48 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERI1Q8IV48 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERI1Q8IV48 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERI1Q8IV48 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERI1Q8IV48 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERI1Q8IV48 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERI1Q8IV48 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERI1Q8IV48 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERI1Q8IV48 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERI1Q8IV48 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERI1Q8IV48 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERI1Q8IV48 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERI1Q8IV48 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ERI1Q8IV48 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERI1Q8IV48 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERI1Q8IV48 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERI1Q8IV48 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERI1Q8IV48 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ERI1Q8IV48 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERI1Q8IV48 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERI1Q8IV48 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ERI1Q8IV48 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERI1Q8IV48 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERI1Q8IV48 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERI1Q8IV48 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERI1Q8IV48 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERI1Q8IV48 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERI1Q8IV48 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERI1Q8IV48 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ERI1Q8IV48 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERI1Q8IV48 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERI1Q8IV48 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERI1Q8IV48 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERI1Q8IV48 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERI1Q8IV48 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERI1Q8IV48 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERI1Q8IV48 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERI1Q8IV48 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERI1Q8IV48 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERI1Q8IV48 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERI1Q8IV48 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERI1Q8IV48 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERI1Q8IV48 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERI1Q8IV48 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ERI1Q8IV48 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERI1Q8IV48 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERI1Q8IV48 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERI1Q8IV48 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERI1Q8IV48 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERI1Q8IV48 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERI1Q8IV48 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERI1Q8IV48 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERI1Q8IV48 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERI1Q8IV48 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERI1Q8IV48 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERI1Q8IV48 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ERI1Q8IV48 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERI1Q8IV48 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERI1Q8IV48 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERI1Q8IV48 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERI1Q8IV48 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERI1Q8IV48 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERI1Q8IV48 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERI1Q8IV48 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERI1Q8IV48 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERI1Q8IV48 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERI1Q8IV48 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ERI1Q8IV48 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ERI1Q8IV48 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERI1Q8IV48 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERI1Q8IV48 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERI1Q8IV48 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERI1Q8IV48 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERI1Q8IV48 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERI1Q8IV48 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERI1Q8IV48 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ERI1Q8IV48 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERI1Q8IV48 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERI1Q8IV48 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ERI1Q8IV48 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms