Protein–RNA interactions for Protein: Q86WN2

IFNE, Interferon epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNEQ86WN2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFNEQ86WN2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
IFNEQ86WN2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IFNEQ86WN2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFNEQ86WN2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFNEQ86WN2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFNEQ86WN2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFNEQ86WN2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFNEQ86WN2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFNEQ86WN2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFNEQ86WN2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFNEQ86WN2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFNEQ86WN2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFNEQ86WN2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFNEQ86WN2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFNEQ86WN2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFNEQ86WN2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFNEQ86WN2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFNEQ86WN2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFNEQ86WN2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFNEQ86WN2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFNEQ86WN2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFNEQ86WN2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFNEQ86WN2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFNEQ86WN2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFNEQ86WN2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFNEQ86WN2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFNEQ86WN2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFNEQ86WN2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFNEQ86WN2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFNEQ86WN2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFNEQ86WN2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFNEQ86WN2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFNEQ86WN2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFNEQ86WN2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFNEQ86WN2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFNEQ86WN2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFNEQ86WN2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFNEQ86WN2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFNEQ86WN2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFNEQ86WN2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFNEQ86WN2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFNEQ86WN2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFNEQ86WN2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFNEQ86WN2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFNEQ86WN2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFNEQ86WN2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFNEQ86WN2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFNEQ86WN2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFNEQ86WN2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFNEQ86WN2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFNEQ86WN2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFNEQ86WN2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFNEQ86WN2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
IFNEQ86WN2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
IFNEQ86WN2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
IFNEQ86WN2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
IFNEQ86WN2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
IFNEQ86WN2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
IFNEQ86WN2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IFNEQ86WN2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IFNEQ86WN2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IFNEQ86WN2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IFNEQ86WN2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IFNEQ86WN2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IFNEQ86WN2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IFNEQ86WN2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFNEQ86WN2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFNEQ86WN2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFNEQ86WN2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFNEQ86WN2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFNEQ86WN2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFNEQ86WN2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFNEQ86WN2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFNEQ86WN2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFNEQ86WN2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFNEQ86WN2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFNEQ86WN2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFNEQ86WN2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFNEQ86WN2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFNEQ86WN2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFNEQ86WN2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
IFNEQ86WN2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFNEQ86WN2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFNEQ86WN2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFNEQ86WN2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
IFNEQ86WN2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFNEQ86WN2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFNEQ86WN2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFNEQ86WN2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFNEQ86WN2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFNEQ86WN2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFNEQ86WN2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFNEQ86WN2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFNEQ86WN2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFNEQ86WN2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFNEQ86WN2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFNEQ86WN2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFNEQ86WN2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFNEQ86WN2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
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