Protein–RNA interactions for Protein: Q86VQ0

LCA5, Lebercilin, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCA5Q86VQ0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LCA5Q86VQ0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LCA5Q86VQ0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LCA5Q86VQ0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LCA5Q86VQ0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LCA5Q86VQ0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LCA5Q86VQ0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
LCA5Q86VQ0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LCA5Q86VQ0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LCA5Q86VQ0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
LCA5Q86VQ0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
LCA5Q86VQ0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LCA5Q86VQ0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LCA5Q86VQ0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LCA5Q86VQ0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LCA5Q86VQ0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LCA5Q86VQ0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LCA5Q86VQ0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LCA5Q86VQ0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LCA5Q86VQ0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LCA5Q86VQ0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LCA5Q86VQ0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LCA5Q86VQ0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LCA5Q86VQ0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LCA5Q86VQ0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LCA5Q86VQ0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LCA5Q86VQ0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LCA5Q86VQ0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LCA5Q86VQ0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LCA5Q86VQ0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LCA5Q86VQ0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LCA5Q86VQ0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
LCA5Q86VQ0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LCA5Q86VQ0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LCA5Q86VQ0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LCA5Q86VQ0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LCA5Q86VQ0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LCA5Q86VQ0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LCA5Q86VQ0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LCA5Q86VQ0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LCA5Q86VQ0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LCA5Q86VQ0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LCA5Q86VQ0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LCA5Q86VQ0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LCA5Q86VQ0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LCA5Q86VQ0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LCA5Q86VQ0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LCA5Q86VQ0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LCA5Q86VQ0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LCA5Q86VQ0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LCA5Q86VQ0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LCA5Q86VQ0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LCA5Q86VQ0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LCA5Q86VQ0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LCA5Q86VQ0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LCA5Q86VQ0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
LCA5Q86VQ0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LCA5Q86VQ0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LCA5Q86VQ0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LCA5Q86VQ0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LCA5Q86VQ0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LCA5Q86VQ0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LCA5Q86VQ0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LCA5Q86VQ0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
LCA5Q86VQ0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LCA5Q86VQ0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LCA5Q86VQ0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LCA5Q86VQ0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LCA5Q86VQ0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LCA5Q86VQ0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LCA5Q86VQ0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LCA5Q86VQ0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LCA5Q86VQ0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LCA5Q86VQ0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LCA5Q86VQ0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LCA5Q86VQ0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LCA5Q86VQ0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LCA5Q86VQ0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LCA5Q86VQ0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LCA5Q86VQ0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LCA5Q86VQ0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LCA5Q86VQ0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LCA5Q86VQ0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LCA5Q86VQ0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LCA5Q86VQ0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LCA5Q86VQ0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LCA5Q86VQ0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LCA5Q86VQ0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LCA5Q86VQ0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
LCA5Q86VQ0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LCA5Q86VQ0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LCA5Q86VQ0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LCA5Q86VQ0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
LCA5Q86VQ0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
LCA5Q86VQ0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LCA5Q86VQ0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LCA5Q86VQ0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LCA5Q86VQ0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LCA5Q86VQ0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LCA5Q86VQ0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms