Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7D3

VTCN1, V-set domain-containing T-cell activation inhibitor 1, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTCN1Q7Z7D3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VTCN1Q7Z7D3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VTCN1Q7Z7D3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VTCN1Q7Z7D3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VTCN1Q7Z7D3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VTCN1Q7Z7D3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VTCN1Q7Z7D3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VTCN1Q7Z7D3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VTCN1Q7Z7D3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VTCN1Q7Z7D3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VTCN1Q7Z7D3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
VTCN1Q7Z7D3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VTCN1Q7Z7D3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VTCN1Q7Z7D3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VTCN1Q7Z7D3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VTCN1Q7Z7D3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VTCN1Q7Z7D3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VTCN1Q7Z7D3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VTCN1Q7Z7D3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VTCN1Q7Z7D3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VTCN1Q7Z7D3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VTCN1Q7Z7D3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VTCN1Q7Z7D3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VTCN1Q7Z7D3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VTCN1Q7Z7D3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VTCN1Q7Z7D3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VTCN1Q7Z7D3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VTCN1Q7Z7D3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VTCN1Q7Z7D3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VTCN1Q7Z7D3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VTCN1Q7Z7D3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VTCN1Q7Z7D3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VTCN1Q7Z7D3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VTCN1Q7Z7D3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VTCN1Q7Z7D3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VTCN1Q7Z7D3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VTCN1Q7Z7D3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VTCN1Q7Z7D3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VTCN1Q7Z7D3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VTCN1Q7Z7D3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VTCN1Q7Z7D3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VTCN1Q7Z7D3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VTCN1Q7Z7D3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VTCN1Q7Z7D3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VTCN1Q7Z7D3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VTCN1Q7Z7D3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VTCN1Q7Z7D3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VTCN1Q7Z7D3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VTCN1Q7Z7D3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VTCN1Q7Z7D3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VTCN1Q7Z7D3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VTCN1Q7Z7D3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VTCN1Q7Z7D3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VTCN1Q7Z7D3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VTCN1Q7Z7D3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VTCN1Q7Z7D3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VTCN1Q7Z7D3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VTCN1Q7Z7D3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VTCN1Q7Z7D3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VTCN1Q7Z7D3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VTCN1Q7Z7D3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
VTCN1Q7Z7D3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
VTCN1Q7Z7D3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VTCN1Q7Z7D3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VTCN1Q7Z7D3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VTCN1Q7Z7D3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VTCN1Q7Z7D3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VTCN1Q7Z7D3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VTCN1Q7Z7D3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VTCN1Q7Z7D3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VTCN1Q7Z7D3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VTCN1Q7Z7D3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VTCN1Q7Z7D3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VTCN1Q7Z7D3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VTCN1Q7Z7D3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VTCN1Q7Z7D3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VTCN1Q7Z7D3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VTCN1Q7Z7D3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VTCN1Q7Z7D3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VTCN1Q7Z7D3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VTCN1Q7Z7D3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VTCN1Q7Z7D3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VTCN1Q7Z7D3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
VTCN1Q7Z7D3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VTCN1Q7Z7D3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VTCN1Q7Z7D3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VTCN1Q7Z7D3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VTCN1Q7Z7D3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VTCN1Q7Z7D3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VTCN1Q7Z7D3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VTCN1Q7Z7D3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VTCN1Q7Z7D3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VTCN1Q7Z7D3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VTCN1Q7Z7D3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VTCN1Q7Z7D3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VTCN1Q7Z7D3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VTCN1Q7Z7D3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
VTCN1Q7Z7D3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VTCN1Q7Z7D3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
VTCN1Q7Z7D3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.3 ms