Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z569

BRAP, BRCA1-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAPQ7Z569 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
BRAPQ7Z569 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
BRAPQ7Z569 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BRAPQ7Z569 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BRAPQ7Z569 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
BRAPQ7Z569 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
BRAPQ7Z569 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
BRAPQ7Z569 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
BRAPQ7Z569 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BRAPQ7Z569 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BRAPQ7Z569 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BRAPQ7Z569 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BRAPQ7Z569 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BRAPQ7Z569 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BRAPQ7Z569 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BRAPQ7Z569 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
BRAPQ7Z569 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BRAPQ7Z569 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
BRAPQ7Z569 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BRAPQ7Z569 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BRAPQ7Z569 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BRAPQ7Z569 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
BRAPQ7Z569 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BRAPQ7Z569 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
BRAPQ7Z569 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
BRAPQ7Z569 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BRAPQ7Z569 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.57■■■□□ 2
BRAPQ7Z569 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BRAPQ7Z569 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
BRAPQ7Z569 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.57■■■□□ 2
BRAPQ7Z569 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BRAPQ7Z569 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
BRAPQ7Z569 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
BRAPQ7Z569 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
BRAPQ7Z569 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
BRAPQ7Z569 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
BRAPQ7Z569 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
BRAPQ7Z569 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
BRAPQ7Z569 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.55■■■□□ 2
BRAPQ7Z569 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.55■■■□□ 2
BRAPQ7Z569 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
BRAPQ7Z569 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
BRAPQ7Z569 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
BRAPQ7Z569 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
BRAPQ7Z569 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
BRAPQ7Z569 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
BRAPQ7Z569 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
BRAPQ7Z569 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BRAPQ7Z569 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BRAPQ7Z569 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BRAPQ7Z569 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
BRAPQ7Z569 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.52■■■□□ 2
BRAPQ7Z569 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
BRAPQ7Z569 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
BRAPQ7Z569 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
BRAPQ7Z569 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
BRAPQ7Z569 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
BRAPQ7Z569 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
BRAPQ7Z569 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
BRAPQ7Z569 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
BRAPQ7Z569 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
BRAPQ7Z569 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
BRAPQ7Z569 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
BRAPQ7Z569 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
BRAPQ7Z569 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
BRAPQ7Z569 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
BRAPQ7Z569 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
BRAPQ7Z569 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
BRAPQ7Z569 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
BRAPQ7Z569 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
BRAPQ7Z569 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
BRAPQ7Z569 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
BRAPQ7Z569 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
BRAPQ7Z569 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
BRAPQ7Z569 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
BRAPQ7Z569 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
BRAPQ7Z569 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
BRAPQ7Z569 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
BRAPQ7Z569 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
BRAPQ7Z569 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
BRAPQ7Z569 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
BRAPQ7Z569 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
BRAPQ7Z569 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
BRAPQ7Z569 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
BRAPQ7Z569 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
BRAPQ7Z569 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
BRAPQ7Z569 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
BRAPQ7Z569 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
BRAPQ7Z569 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
BRAPQ7Z569 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
BRAPQ7Z569 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
BRAPQ7Z569 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
BRAPQ7Z569 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
BRAPQ7Z569 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
BRAPQ7Z569 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
BRAPQ7Z569 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
BRAPQ7Z569 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
BRAPQ7Z569 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
BRAPQ7Z569 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
BRAPQ7Z569 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms