Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3J2

C16orf62, UPF0505 protein C16orf62, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf62Q7Z3J2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C16orf62Q7Z3J2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C16orf62Q7Z3J2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C16orf62Q7Z3J2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C16orf62Q7Z3J2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C16orf62Q7Z3J2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C16orf62Q7Z3J2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C16orf62Q7Z3J2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C16orf62Q7Z3J2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
C16orf62Q7Z3J2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C16orf62Q7Z3J2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
C16orf62Q7Z3J2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C16orf62Q7Z3J2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C16orf62Q7Z3J2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C16orf62Q7Z3J2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
C16orf62Q7Z3J2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C16orf62Q7Z3J2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C16orf62Q7Z3J2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C16orf62Q7Z3J2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C16orf62Q7Z3J2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C16orf62Q7Z3J2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C16orf62Q7Z3J2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
C16orf62Q7Z3J2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
C16orf62Q7Z3J2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C16orf62Q7Z3J2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C16orf62Q7Z3J2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C16orf62Q7Z3J2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C16orf62Q7Z3J2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C16orf62Q7Z3J2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
C16orf62Q7Z3J2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
C16orf62Q7Z3J2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C16orf62Q7Z3J2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
C16orf62Q7Z3J2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C16orf62Q7Z3J2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C16orf62Q7Z3J2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C16orf62Q7Z3J2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C16orf62Q7Z3J2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C16orf62Q7Z3J2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C16orf62Q7Z3J2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C16orf62Q7Z3J2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C16orf62Q7Z3J2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C16orf62Q7Z3J2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C16orf62Q7Z3J2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C16orf62Q7Z3J2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C16orf62Q7Z3J2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C16orf62Q7Z3J2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C16orf62Q7Z3J2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
C16orf62Q7Z3J2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C16orf62Q7Z3J2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C16orf62Q7Z3J2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C16orf62Q7Z3J2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C16orf62Q7Z3J2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C16orf62Q7Z3J2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C16orf62Q7Z3J2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C16orf62Q7Z3J2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C16orf62Q7Z3J2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C16orf62Q7Z3J2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C16orf62Q7Z3J2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C16orf62Q7Z3J2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C16orf62Q7Z3J2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C16orf62Q7Z3J2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C16orf62Q7Z3J2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
C16orf62Q7Z3J2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
C16orf62Q7Z3J2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
C16orf62Q7Z3J2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
C16orf62Q7Z3J2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
C16orf62Q7Z3J2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
C16orf62Q7Z3J2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C16orf62Q7Z3J2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C16orf62Q7Z3J2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C16orf62Q7Z3J2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
C16orf62Q7Z3J2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C16orf62Q7Z3J2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C16orf62Q7Z3J2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C16orf62Q7Z3J2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C16orf62Q7Z3J2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C16orf62Q7Z3J2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C16orf62Q7Z3J2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C16orf62Q7Z3J2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C16orf62Q7Z3J2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C16orf62Q7Z3J2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C16orf62Q7Z3J2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C16orf62Q7Z3J2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C16orf62Q7Z3J2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C16orf62Q7Z3J2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C16orf62Q7Z3J2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C16orf62Q7Z3J2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C16orf62Q7Z3J2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C16orf62Q7Z3J2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C16orf62Q7Z3J2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C16orf62Q7Z3J2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
C16orf62Q7Z3J2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C16orf62Q7Z3J2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C16orf62Q7Z3J2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C16orf62Q7Z3J2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C16orf62Q7Z3J2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C16orf62Q7Z3J2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C16orf62Q7Z3J2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C16orf62Q7Z3J2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C16orf62Q7Z3J2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms