Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B1

NEGR1, Neuronal growth regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEGR1Q7Z3B1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEGR1Q7Z3B1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEGR1Q7Z3B1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEGR1Q7Z3B1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEGR1Q7Z3B1 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NEGR1Q7Z3B1 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NEGR1Q7Z3B1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NEGR1Q7Z3B1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NEGR1Q7Z3B1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NEGR1Q7Z3B1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NEGR1Q7Z3B1 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NEGR1Q7Z3B1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NEGR1Q7Z3B1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NEGR1Q7Z3B1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
NEGR1Q7Z3B1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NEGR1Q7Z3B1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NEGR1Q7Z3B1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NEGR1Q7Z3B1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NEGR1Q7Z3B1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NEGR1Q7Z3B1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NEGR1Q7Z3B1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
NEGR1Q7Z3B1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NEGR1Q7Z3B1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
NEGR1Q7Z3B1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NEGR1Q7Z3B1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NEGR1Q7Z3B1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NEGR1Q7Z3B1 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NEGR1Q7Z3B1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NEGR1Q7Z3B1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NEGR1Q7Z3B1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NEGR1Q7Z3B1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NEGR1Q7Z3B1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NEGR1Q7Z3B1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NEGR1Q7Z3B1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NEGR1Q7Z3B1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NEGR1Q7Z3B1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NEGR1Q7Z3B1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
NEGR1Q7Z3B1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NEGR1Q7Z3B1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NEGR1Q7Z3B1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NEGR1Q7Z3B1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NEGR1Q7Z3B1 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NEGR1Q7Z3B1 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NEGR1Q7Z3B1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEGR1Q7Z3B1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NEGR1Q7Z3B1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEGR1Q7Z3B1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEGR1Q7Z3B1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEGR1Q7Z3B1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEGR1Q7Z3B1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEGR1Q7Z3B1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NEGR1Q7Z3B1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NEGR1Q7Z3B1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NEGR1Q7Z3B1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NEGR1Q7Z3B1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NEGR1Q7Z3B1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NEGR1Q7Z3B1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NEGR1Q7Z3B1 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NEGR1Q7Z3B1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NEGR1Q7Z3B1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NEGR1Q7Z3B1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NEGR1Q7Z3B1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NEGR1Q7Z3B1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NEGR1Q7Z3B1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
NEGR1Q7Z3B1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NEGR1Q7Z3B1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NEGR1Q7Z3B1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NEGR1Q7Z3B1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
NEGR1Q7Z3B1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NEGR1Q7Z3B1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NEGR1Q7Z3B1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NEGR1Q7Z3B1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NEGR1Q7Z3B1 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NEGR1Q7Z3B1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NEGR1Q7Z3B1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NEGR1Q7Z3B1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NEGR1Q7Z3B1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NEGR1Q7Z3B1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NEGR1Q7Z3B1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NEGR1Q7Z3B1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
NEGR1Q7Z3B1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NEGR1Q7Z3B1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NEGR1Q7Z3B1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NEGR1Q7Z3B1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NEGR1Q7Z3B1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NEGR1Q7Z3B1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NEGR1Q7Z3B1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEGR1Q7Z3B1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEGR1Q7Z3B1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEGR1Q7Z3B1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEGR1Q7Z3B1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEGR1Q7Z3B1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
NEGR1Q7Z3B1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEGR1Q7Z3B1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEGR1Q7Z3B1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEGR1Q7Z3B1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEGR1Q7Z3B1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEGR1Q7Z3B1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NEGR1Q7Z3B1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NEGR1Q7Z3B1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms