Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT6

SSX6, Putative protein SSX6, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX6Q7RTT6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SSX6Q7RTT6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SSX6Q7RTT6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SSX6Q7RTT6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SSX6Q7RTT6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SSX6Q7RTT6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SSX6Q7RTT6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SSX6Q7RTT6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SSX6Q7RTT6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SSX6Q7RTT6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SSX6Q7RTT6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SSX6Q7RTT6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SSX6Q7RTT6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SSX6Q7RTT6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
SSX6Q7RTT6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SSX6Q7RTT6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SSX6Q7RTT6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SSX6Q7RTT6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SSX6Q7RTT6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SSX6Q7RTT6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SSX6Q7RTT6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SSX6Q7RTT6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SSX6Q7RTT6 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SSX6Q7RTT6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SSX6Q7RTT6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SSX6Q7RTT6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SSX6Q7RTT6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SSX6Q7RTT6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
SSX6Q7RTT6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SSX6Q7RTT6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SSX6Q7RTT6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SSX6Q7RTT6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SSX6Q7RTT6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SSX6Q7RTT6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SSX6Q7RTT6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SSX6Q7RTT6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SSX6Q7RTT6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SSX6Q7RTT6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SSX6Q7RTT6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SSX6Q7RTT6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SSX6Q7RTT6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SSX6Q7RTT6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SSX6Q7RTT6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SSX6Q7RTT6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SSX6Q7RTT6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SSX6Q7RTT6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SSX6Q7RTT6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SSX6Q7RTT6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SSX6Q7RTT6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SSX6Q7RTT6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SSX6Q7RTT6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SSX6Q7RTT6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SSX6Q7RTT6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SSX6Q7RTT6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SSX6Q7RTT6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
SSX6Q7RTT6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SSX6Q7RTT6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SSX6Q7RTT6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SSX6Q7RTT6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SSX6Q7RTT6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SSX6Q7RTT6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SSX6Q7RTT6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SSX6Q7RTT6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SSX6Q7RTT6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SSX6Q7RTT6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SSX6Q7RTT6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SSX6Q7RTT6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SSX6Q7RTT6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SSX6Q7RTT6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SSX6Q7RTT6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SSX6Q7RTT6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SSX6Q7RTT6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SSX6Q7RTT6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSX6Q7RTT6 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSX6Q7RTT6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSX6Q7RTT6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSX6Q7RTT6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSX6Q7RTT6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSX6Q7RTT6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSX6Q7RTT6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSX6Q7RTT6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSX6Q7RTT6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSX6Q7RTT6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SSX6Q7RTT6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SSX6Q7RTT6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SSX6Q7RTT6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SSX6Q7RTT6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SSX6Q7RTT6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SSX6Q7RTT6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SSX6Q7RTT6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SSX6Q7RTT6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SSX6Q7RTT6 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SSX6Q7RTT6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SSX6Q7RTT6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SSX6Q7RTT6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SSX6Q7RTT6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SSX6Q7RTT6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SSX6Q7RTT6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SSX6Q7RTT6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SSX6Q7RTT6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms