Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL3

USP50, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 50, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP50Q70EL3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
USP50Q70EL3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
USP50Q70EL3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
USP50Q70EL3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
USP50Q70EL3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
USP50Q70EL3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
USP50Q70EL3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
USP50Q70EL3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
USP50Q70EL3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
USP50Q70EL3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
USP50Q70EL3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
USP50Q70EL3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
USP50Q70EL3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
USP50Q70EL3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
USP50Q70EL3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC29.05■■■□□ 2.24
USP50Q70EL3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
USP50Q70EL3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
USP50Q70EL3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
USP50Q70EL3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
USP50Q70EL3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
USP50Q70EL3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
USP50Q70EL3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
USP50Q70EL3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
USP50Q70EL3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
USP50Q70EL3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
USP50Q70EL3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
USP50Q70EL3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
USP50Q70EL3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
USP50Q70EL3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
USP50Q70EL3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
USP50Q70EL3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
USP50Q70EL3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
USP50Q70EL3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
USP50Q70EL3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
USP50Q70EL3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
USP50Q70EL3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
USP50Q70EL3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
USP50Q70EL3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
USP50Q70EL3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
USP50Q70EL3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
USP50Q70EL3 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
USP50Q70EL3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
USP50Q70EL3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
USP50Q70EL3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
USP50Q70EL3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
USP50Q70EL3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
USP50Q70EL3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
USP50Q70EL3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
USP50Q70EL3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
USP50Q70EL3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
USP50Q70EL3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
USP50Q70EL3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
USP50Q70EL3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
USP50Q70EL3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
USP50Q70EL3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
USP50Q70EL3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
USP50Q70EL3 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
USP50Q70EL3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
USP50Q70EL3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
USP50Q70EL3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
USP50Q70EL3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
USP50Q70EL3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
USP50Q70EL3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
USP50Q70EL3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
USP50Q70EL3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
USP50Q70EL3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
USP50Q70EL3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
USP50Q70EL3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
USP50Q70EL3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
USP50Q70EL3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
USP50Q70EL3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
USP50Q70EL3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
USP50Q70EL3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
USP50Q70EL3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
USP50Q70EL3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP50Q70EL3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP50Q70EL3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP50Q70EL3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
USP50Q70EL3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
USP50Q70EL3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
USP50Q70EL3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
USP50Q70EL3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
USP50Q70EL3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
USP50Q70EL3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
USP50Q70EL3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
USP50Q70EL3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
USP50Q70EL3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
USP50Q70EL3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
USP50Q70EL3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
USP50Q70EL3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
USP50Q70EL3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
USP50Q70EL3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
USP50Q70EL3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
USP50Q70EL3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
USP50Q70EL3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
USP50Q70EL3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
USP50Q70EL3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
USP50Q70EL3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
USP50Q70EL3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
USP50Q70EL3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.6 ms