Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN8

CCNI2, Cyclin-I2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNI2Q6ZMN8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CCNI2Q6ZMN8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCNI2Q6ZMN8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCNI2Q6ZMN8 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CCNI2Q6ZMN8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCNI2Q6ZMN8 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCNI2Q6ZMN8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCNI2Q6ZMN8 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCNI2Q6ZMN8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCNI2Q6ZMN8 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCNI2Q6ZMN8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCNI2Q6ZMN8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCNI2Q6ZMN8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCNI2Q6ZMN8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCNI2Q6ZMN8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCNI2Q6ZMN8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCNI2Q6ZMN8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCNI2Q6ZMN8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCNI2Q6ZMN8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCNI2Q6ZMN8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CCNI2Q6ZMN8 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CCNI2Q6ZMN8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCNI2Q6ZMN8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CCNI2Q6ZMN8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCNI2Q6ZMN8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCNI2Q6ZMN8 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCNI2Q6ZMN8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCNI2Q6ZMN8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCNI2Q6ZMN8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCNI2Q6ZMN8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCNI2Q6ZMN8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCNI2Q6ZMN8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCNI2Q6ZMN8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCNI2Q6ZMN8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCNI2Q6ZMN8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CCNI2Q6ZMN8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCNI2Q6ZMN8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCNI2Q6ZMN8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCNI2Q6ZMN8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCNI2Q6ZMN8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCNI2Q6ZMN8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCNI2Q6ZMN8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCNI2Q6ZMN8 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCNI2Q6ZMN8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCNI2Q6ZMN8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCNI2Q6ZMN8 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCNI2Q6ZMN8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCNI2Q6ZMN8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCNI2Q6ZMN8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCNI2Q6ZMN8 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCNI2Q6ZMN8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCNI2Q6ZMN8 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCNI2Q6ZMN8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCNI2Q6ZMN8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCNI2Q6ZMN8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCNI2Q6ZMN8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCNI2Q6ZMN8 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCNI2Q6ZMN8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCNI2Q6ZMN8 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCNI2Q6ZMN8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCNI2Q6ZMN8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCNI2Q6ZMN8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCNI2Q6ZMN8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCNI2Q6ZMN8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCNI2Q6ZMN8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCNI2Q6ZMN8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCNI2Q6ZMN8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCNI2Q6ZMN8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCNI2Q6ZMN8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCNI2Q6ZMN8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCNI2Q6ZMN8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCNI2Q6ZMN8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCNI2Q6ZMN8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCNI2Q6ZMN8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCNI2Q6ZMN8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCNI2Q6ZMN8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCNI2Q6ZMN8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCNI2Q6ZMN8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCNI2Q6ZMN8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCNI2Q6ZMN8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCNI2Q6ZMN8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCNI2Q6ZMN8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCNI2Q6ZMN8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCNI2Q6ZMN8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCNI2Q6ZMN8 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCNI2Q6ZMN8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCNI2Q6ZMN8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCNI2Q6ZMN8 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCNI2Q6ZMN8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCNI2Q6ZMN8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCNI2Q6ZMN8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCNI2Q6ZMN8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CCNI2Q6ZMN8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCNI2Q6ZMN8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCNI2Q6ZMN8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCNI2Q6ZMN8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CCNI2Q6ZMN8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCNI2Q6ZMN8 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCNI2Q6ZMN8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCNI2Q6ZMN8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.4 ms