Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXS9

CASP12, Inactive caspase-12, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP12Q6UXS9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASP12Q6UXS9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASP12Q6UXS9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASP12Q6UXS9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASP12Q6UXS9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASP12Q6UXS9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CASP12Q6UXS9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASP12Q6UXS9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASP12Q6UXS9 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASP12Q6UXS9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASP12Q6UXS9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASP12Q6UXS9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASP12Q6UXS9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASP12Q6UXS9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASP12Q6UXS9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASP12Q6UXS9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASP12Q6UXS9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASP12Q6UXS9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASP12Q6UXS9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASP12Q6UXS9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASP12Q6UXS9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASP12Q6UXS9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASP12Q6UXS9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASP12Q6UXS9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASP12Q6UXS9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASP12Q6UXS9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CASP12Q6UXS9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASP12Q6UXS9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASP12Q6UXS9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASP12Q6UXS9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASP12Q6UXS9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASP12Q6UXS9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASP12Q6UXS9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CASP12Q6UXS9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CASP12Q6UXS9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CASP12Q6UXS9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CASP12Q6UXS9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CASP12Q6UXS9 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CASP12Q6UXS9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CASP12Q6UXS9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASP12Q6UXS9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASP12Q6UXS9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASP12Q6UXS9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASP12Q6UXS9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASP12Q6UXS9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASP12Q6UXS9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASP12Q6UXS9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASP12Q6UXS9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASP12Q6UXS9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASP12Q6UXS9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASP12Q6UXS9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASP12Q6UXS9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASP12Q6UXS9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASP12Q6UXS9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASP12Q6UXS9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASP12Q6UXS9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASP12Q6UXS9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASP12Q6UXS9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CASP12Q6UXS9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CASP12Q6UXS9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASP12Q6UXS9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASP12Q6UXS9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASP12Q6UXS9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASP12Q6UXS9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASP12Q6UXS9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASP12Q6UXS9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASP12Q6UXS9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASP12Q6UXS9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASP12Q6UXS9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASP12Q6UXS9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CASP12Q6UXS9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASP12Q6UXS9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASP12Q6UXS9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASP12Q6UXS9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP12Q6UXS9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP12Q6UXS9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP12Q6UXS9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP12Q6UXS9 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP12Q6UXS9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP12Q6UXS9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP12Q6UXS9 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP12Q6UXS9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP12Q6UXS9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CASP12Q6UXS9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASP12Q6UXS9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASP12Q6UXS9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASP12Q6UXS9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CASP12Q6UXS9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASP12Q6UXS9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASP12Q6UXS9 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASP12Q6UXS9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASP12Q6UXS9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CASP12Q6UXS9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASP12Q6UXS9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CASP12Q6UXS9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASP12Q6UXS9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASP12Q6UXS9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CASP12Q6UXS9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CASP12Q6UXS9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CASP12Q6UXS9 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms