Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWP8

SBSN, Suprabasin, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBSNQ6UWP8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SBSNQ6UWP8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SBSNQ6UWP8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SBSNQ6UWP8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SBSNQ6UWP8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SBSNQ6UWP8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SBSNQ6UWP8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SBSNQ6UWP8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SBSNQ6UWP8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SBSNQ6UWP8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SBSNQ6UWP8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SBSNQ6UWP8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SBSNQ6UWP8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SBSNQ6UWP8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SBSNQ6UWP8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SBSNQ6UWP8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SBSNQ6UWP8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SBSNQ6UWP8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SBSNQ6UWP8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SBSNQ6UWP8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SBSNQ6UWP8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SBSNQ6UWP8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SBSNQ6UWP8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SBSNQ6UWP8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SBSNQ6UWP8 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SBSNQ6UWP8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SBSNQ6UWP8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SBSNQ6UWP8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SBSNQ6UWP8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SBSNQ6UWP8 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SBSNQ6UWP8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SBSNQ6UWP8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SBSNQ6UWP8 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SBSNQ6UWP8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SBSNQ6UWP8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SBSNQ6UWP8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SBSNQ6UWP8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SBSNQ6UWP8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SBSNQ6UWP8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SBSNQ6UWP8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SBSNQ6UWP8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SBSNQ6UWP8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SBSNQ6UWP8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SBSNQ6UWP8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SBSNQ6UWP8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SBSNQ6UWP8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SBSNQ6UWP8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SBSNQ6UWP8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SBSNQ6UWP8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SBSNQ6UWP8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SBSNQ6UWP8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SBSNQ6UWP8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SBSNQ6UWP8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SBSNQ6UWP8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SBSNQ6UWP8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SBSNQ6UWP8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SBSNQ6UWP8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SBSNQ6UWP8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SBSNQ6UWP8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SBSNQ6UWP8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SBSNQ6UWP8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SBSNQ6UWP8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SBSNQ6UWP8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SBSNQ6UWP8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SBSNQ6UWP8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SBSNQ6UWP8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SBSNQ6UWP8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SBSNQ6UWP8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SBSNQ6UWP8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SBSNQ6UWP8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SBSNQ6UWP8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SBSNQ6UWP8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SBSNQ6UWP8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SBSNQ6UWP8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SBSNQ6UWP8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SBSNQ6UWP8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SBSNQ6UWP8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SBSNQ6UWP8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SBSNQ6UWP8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SBSNQ6UWP8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SBSNQ6UWP8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SBSNQ6UWP8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SBSNQ6UWP8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SBSNQ6UWP8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SBSNQ6UWP8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SBSNQ6UWP8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SBSNQ6UWP8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SBSNQ6UWP8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SBSNQ6UWP8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SBSNQ6UWP8 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SBSNQ6UWP8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SBSNQ6UWP8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SBSNQ6UWP8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SBSNQ6UWP8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SBSNQ6UWP8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SBSNQ6UWP8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SBSNQ6UWP8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SBSNQ6UWP8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SBSNQ6UWP8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SBSNQ6UWP8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141.9 ms