Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q6P435 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q6P435 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q6P435 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q6P435 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q6P435 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q6P435 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q6P435 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q6P435 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q6P435 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q6P435 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q6P435 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q6P435 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q6P435 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q6P435 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q6P435 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q6P435 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q6P435 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q6P435 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q6P435 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q6P435 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q6P435 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q6P435 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q6P435 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Q6P435 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q6P435 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q6P435 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q6P435 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q6P435 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q6P435 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q6P435 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q6P435 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q6P435 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q6P435 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q6P435 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q6P435 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q6P435 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q6P435 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q6P435 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Q6P435 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q6P435 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q6P435 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q6P435 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q6P435 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q6P435 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Q6P435 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q6P435 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q6P435 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q6P435 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q6P435 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q6P435 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Q6P435 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q6P435 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Q6P435 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Q6P435 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q6P435 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q6P435 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q6P435 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q6P435 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q6P435 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q6P435 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q6P435 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q6P435 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q6P435 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q6P435 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q6P435 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q6P435 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q6P435 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q6P435 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q6P435 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Q6P435 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q6P435 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q6P435 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q6P435 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Q6P435 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q6P435 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Q6P435 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Q6P435 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Q6P435 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q6P435 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q6P435 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q6P435 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Q6P435 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q6P435 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q6P435 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q6P435 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q6P435 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q6P435 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q6P435 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q6P435 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q6P435 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q6P435 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q6P435 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q6P435 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q6P435 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Q6P435 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q6P435 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q6P435 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q6P435 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q6P435 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms