Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT52

CGB2, Choriogonadotropin subunit beta variant 2, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGB2Q6NT52 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CGB2Q6NT52 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CGB2Q6NT52 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CGB2Q6NT52 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CGB2Q6NT52 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CGB2Q6NT52 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CGB2Q6NT52 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CGB2Q6NT52 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CGB2Q6NT52 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CGB2Q6NT52 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CGB2Q6NT52 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CGB2Q6NT52 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CGB2Q6NT52 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CGB2Q6NT52 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CGB2Q6NT52 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CGB2Q6NT52 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CGB2Q6NT52 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CGB2Q6NT52 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CGB2Q6NT52 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CGB2Q6NT52 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CGB2Q6NT52 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CGB2Q6NT52 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CGB2Q6NT52 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CGB2Q6NT52 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CGB2Q6NT52 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CGB2Q6NT52 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CGB2Q6NT52 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CGB2Q6NT52 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CGB2Q6NT52 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CGB2Q6NT52 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CGB2Q6NT52 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CGB2Q6NT52 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CGB2Q6NT52 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CGB2Q6NT52 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CGB2Q6NT52 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CGB2Q6NT52 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CGB2Q6NT52 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CGB2Q6NT52 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CGB2Q6NT52 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CGB2Q6NT52 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CGB2Q6NT52 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CGB2Q6NT52 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CGB2Q6NT52 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CGB2Q6NT52 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CGB2Q6NT52 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CGB2Q6NT52 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CGB2Q6NT52 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CGB2Q6NT52 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CGB2Q6NT52 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CGB2Q6NT52 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CGB2Q6NT52 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CGB2Q6NT52 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CGB2Q6NT52 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CGB2Q6NT52 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CGB2Q6NT52 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CGB2Q6NT52 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CGB2Q6NT52 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CGB2Q6NT52 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CGB2Q6NT52 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CGB2Q6NT52 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CGB2Q6NT52 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CGB2Q6NT52 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CGB2Q6NT52 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CGB2Q6NT52 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CGB2Q6NT52 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
CGB2Q6NT52 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CGB2Q6NT52 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CGB2Q6NT52 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CGB2Q6NT52 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CGB2Q6NT52 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CGB2Q6NT52 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CGB2Q6NT52 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CGB2Q6NT52 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CGB2Q6NT52 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CGB2Q6NT52 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CGB2Q6NT52 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CGB2Q6NT52 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CGB2Q6NT52 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CGB2Q6NT52 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CGB2Q6NT52 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CGB2Q6NT52 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CGB2Q6NT52 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CGB2Q6NT52 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CGB2Q6NT52 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CGB2Q6NT52 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CGB2Q6NT52 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CGB2Q6NT52 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CGB2Q6NT52 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CGB2Q6NT52 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CGB2Q6NT52 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CGB2Q6NT52 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CGB2Q6NT52 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CGB2Q6NT52 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CGB2Q6NT52 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CGB2Q6NT52 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CGB2Q6NT52 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CGB2Q6NT52 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CGB2Q6NT52 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CGB2Q6NT52 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CGB2Q6NT52 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms