Protein–RNA interactions for Protein: Q6ICL7

SLC35E4, Solute carrier family 35 member E4, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35E4Q6ICL7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC35E4Q6ICL7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC35E4Q6ICL7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC35E4Q6ICL7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC35E4Q6ICL7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC35E4Q6ICL7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC35E4Q6ICL7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC35E4Q6ICL7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC35E4Q6ICL7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC35E4Q6ICL7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC35E4Q6ICL7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC35E4Q6ICL7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC35E4Q6ICL7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC35E4Q6ICL7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC35E4Q6ICL7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC35E4Q6ICL7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC35E4Q6ICL7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC35E4Q6ICL7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC35E4Q6ICL7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC35E4Q6ICL7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC35E4Q6ICL7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC35E4Q6ICL7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC35E4Q6ICL7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC35E4Q6ICL7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC35E4Q6ICL7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC35E4Q6ICL7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC35E4Q6ICL7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC35E4Q6ICL7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC35E4Q6ICL7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC35E4Q6ICL7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC35E4Q6ICL7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC35E4Q6ICL7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC35E4Q6ICL7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC35E4Q6ICL7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC35E4Q6ICL7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC35E4Q6ICL7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC35E4Q6ICL7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC35E4Q6ICL7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC35E4Q6ICL7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC35E4Q6ICL7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC35E4Q6ICL7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC35E4Q6ICL7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC35E4Q6ICL7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC35E4Q6ICL7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC35E4Q6ICL7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC35E4Q6ICL7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC35E4Q6ICL7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC35E4Q6ICL7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC35E4Q6ICL7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC35E4Q6ICL7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC35E4Q6ICL7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC35E4Q6ICL7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC35E4Q6ICL7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC35E4Q6ICL7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC35E4Q6ICL7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC35E4Q6ICL7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC35E4Q6ICL7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC35E4Q6ICL7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC35E4Q6ICL7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC35E4Q6ICL7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC35E4Q6ICL7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC35E4Q6ICL7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC35E4Q6ICL7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC35E4Q6ICL7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC35E4Q6ICL7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC35E4Q6ICL7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC35E4Q6ICL7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC35E4Q6ICL7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SLC35E4Q6ICL7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SLC35E4Q6ICL7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC35E4Q6ICL7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SLC35E4Q6ICL7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SLC35E4Q6ICL7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC35E4Q6ICL7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC35E4Q6ICL7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC35E4Q6ICL7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC35E4Q6ICL7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC35E4Q6ICL7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC35E4Q6ICL7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC35E4Q6ICL7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC35E4Q6ICL7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC35E4Q6ICL7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC35E4Q6ICL7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC35E4Q6ICL7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC35E4Q6ICL7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC35E4Q6ICL7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC35E4Q6ICL7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC35E4Q6ICL7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC35E4Q6ICL7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC35E4Q6ICL7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC35E4Q6ICL7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC35E4Q6ICL7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC35E4Q6ICL7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC35E4Q6ICL7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC35E4Q6ICL7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC35E4Q6ICL7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC35E4Q6ICL7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC35E4Q6ICL7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC35E4Q6ICL7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC35E4Q6ICL7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms