Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI14

SLC9A4, Sodium/hydrogen exchanger 4, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A4Q6AI14 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC9A4Q6AI14 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC9A4Q6AI14 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC9A4Q6AI14 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC9A4Q6AI14 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC9A4Q6AI14 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC9A4Q6AI14 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC9A4Q6AI14 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC9A4Q6AI14 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC9A4Q6AI14 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC9A4Q6AI14 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC9A4Q6AI14 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC9A4Q6AI14 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC9A4Q6AI14 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC9A4Q6AI14 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC9A4Q6AI14 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC9A4Q6AI14 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC9A4Q6AI14 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC9A4Q6AI14 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC9A4Q6AI14 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC9A4Q6AI14 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC9A4Q6AI14 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC9A4Q6AI14 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC9A4Q6AI14 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC9A4Q6AI14 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC9A4Q6AI14 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC9A4Q6AI14 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC9A4Q6AI14 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC9A4Q6AI14 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC9A4Q6AI14 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC9A4Q6AI14 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC9A4Q6AI14 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC9A4Q6AI14 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC9A4Q6AI14 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC9A4Q6AI14 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC9A4Q6AI14 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC9A4Q6AI14 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC9A4Q6AI14 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC9A4Q6AI14 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC9A4Q6AI14 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC9A4Q6AI14 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC9A4Q6AI14 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC9A4Q6AI14 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC9A4Q6AI14 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC9A4Q6AI14 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC9A4Q6AI14 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC9A4Q6AI14 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC9A4Q6AI14 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC9A4Q6AI14 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC9A4Q6AI14 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC9A4Q6AI14 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC9A4Q6AI14 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC9A4Q6AI14 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC9A4Q6AI14 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC9A4Q6AI14 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC9A4Q6AI14 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC9A4Q6AI14 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC9A4Q6AI14 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC9A4Q6AI14 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC9A4Q6AI14 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC9A4Q6AI14 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC9A4Q6AI14 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC9A4Q6AI14 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC9A4Q6AI14 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SLC9A4Q6AI14 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC9A4Q6AI14 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC9A4Q6AI14 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC9A4Q6AI14 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC9A4Q6AI14 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC9A4Q6AI14 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC9A4Q6AI14 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC9A4Q6AI14 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC9A4Q6AI14 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC9A4Q6AI14 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC9A4Q6AI14 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC9A4Q6AI14 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC9A4Q6AI14 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC9A4Q6AI14 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC9A4Q6AI14 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC9A4Q6AI14 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC9A4Q6AI14 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC9A4Q6AI14 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC9A4Q6AI14 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC9A4Q6AI14 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC9A4Q6AI14 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC9A4Q6AI14 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC9A4Q6AI14 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC9A4Q6AI14 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC9A4Q6AI14 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC9A4Q6AI14 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC9A4Q6AI14 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC9A4Q6AI14 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC9A4Q6AI14 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC9A4Q6AI14 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC9A4Q6AI14 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC9A4Q6AI14 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC9A4Q6AI14 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC9A4Q6AI14 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC9A4Q6AI14 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC9A4Q6AI14 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms