Protein–RNA interactions for Protein: Q5W5X9

TTC23, Tetratricopeptide repeat protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC23Q5W5X9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTC23Q5W5X9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TTC23Q5W5X9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTC23Q5W5X9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTC23Q5W5X9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTC23Q5W5X9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTC23Q5W5X9 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTC23Q5W5X9 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTC23Q5W5X9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTC23Q5W5X9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTC23Q5W5X9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTC23Q5W5X9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTC23Q5W5X9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTC23Q5W5X9 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTC23Q5W5X9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTC23Q5W5X9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTC23Q5W5X9 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTC23Q5W5X9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTC23Q5W5X9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTC23Q5W5X9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTC23Q5W5X9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTC23Q5W5X9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTC23Q5W5X9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTC23Q5W5X9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTC23Q5W5X9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTC23Q5W5X9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTC23Q5W5X9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTC23Q5W5X9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTC23Q5W5X9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TTC23Q5W5X9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TTC23Q5W5X9 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TTC23Q5W5X9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTC23Q5W5X9 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTC23Q5W5X9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTC23Q5W5X9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTC23Q5W5X9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTC23Q5W5X9 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTC23Q5W5X9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTC23Q5W5X9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC23Q5W5X9 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC23Q5W5X9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC23Q5W5X9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC23Q5W5X9 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC23Q5W5X9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC23Q5W5X9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC23Q5W5X9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC23Q5W5X9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTC23Q5W5X9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTC23Q5W5X9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TTC23Q5W5X9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTC23Q5W5X9 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTC23Q5W5X9 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTC23Q5W5X9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTC23Q5W5X9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTC23Q5W5X9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTC23Q5W5X9 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TTC23Q5W5X9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTC23Q5W5X9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTC23Q5W5X9 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTC23Q5W5X9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTC23Q5W5X9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTC23Q5W5X9 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTC23Q5W5X9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTC23Q5W5X9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTC23Q5W5X9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTC23Q5W5X9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTC23Q5W5X9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TTC23Q5W5X9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TTC23Q5W5X9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TTC23Q5W5X9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TTC23Q5W5X9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TTC23Q5W5X9 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTC23Q5W5X9 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTC23Q5W5X9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTC23Q5W5X9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTC23Q5W5X9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTC23Q5W5X9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TTC23Q5W5X9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TTC23Q5W5X9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TTC23Q5W5X9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TTC23Q5W5X9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TTC23Q5W5X9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TTC23Q5W5X9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TTC23Q5W5X9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTC23Q5W5X9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTC23Q5W5X9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTC23Q5W5X9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTC23Q5W5X9 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTC23Q5W5X9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTC23Q5W5X9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTC23Q5W5X9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTC23Q5W5X9 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TTC23Q5W5X9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTC23Q5W5X9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTC23Q5W5X9 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTC23Q5W5X9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTC23Q5W5X9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTC23Q5W5X9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTC23Q5W5X9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTC23Q5W5X9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms