Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGY1

TMCO4, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO4Q5TGY1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMCO4Q5TGY1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMCO4Q5TGY1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMCO4Q5TGY1 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMCO4Q5TGY1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMCO4Q5TGY1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMCO4Q5TGY1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMCO4Q5TGY1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMCO4Q5TGY1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMCO4Q5TGY1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TMCO4Q5TGY1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMCO4Q5TGY1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMCO4Q5TGY1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMCO4Q5TGY1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMCO4Q5TGY1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMCO4Q5TGY1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMCO4Q5TGY1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TMCO4Q5TGY1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMCO4Q5TGY1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMCO4Q5TGY1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMCO4Q5TGY1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMCO4Q5TGY1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMCO4Q5TGY1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMCO4Q5TGY1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMCO4Q5TGY1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TMCO4Q5TGY1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TMCO4Q5TGY1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TMCO4Q5TGY1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMCO4Q5TGY1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMCO4Q5TGY1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TMCO4Q5TGY1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMCO4Q5TGY1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TMCO4Q5TGY1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMCO4Q5TGY1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMCO4Q5TGY1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMCO4Q5TGY1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMCO4Q5TGY1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMCO4Q5TGY1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMCO4Q5TGY1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMCO4Q5TGY1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMCO4Q5TGY1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMCO4Q5TGY1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMCO4Q5TGY1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMCO4Q5TGY1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMCO4Q5TGY1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMCO4Q5TGY1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMCO4Q5TGY1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMCO4Q5TGY1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMCO4Q5TGY1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMCO4Q5TGY1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMCO4Q5TGY1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMCO4Q5TGY1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMCO4Q5TGY1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMCO4Q5TGY1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMCO4Q5TGY1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMCO4Q5TGY1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMCO4Q5TGY1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TMCO4Q5TGY1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMCO4Q5TGY1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TMCO4Q5TGY1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TMCO4Q5TGY1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMCO4Q5TGY1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMCO4Q5TGY1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMCO4Q5TGY1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMCO4Q5TGY1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TMCO4Q5TGY1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMCO4Q5TGY1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMCO4Q5TGY1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMCO4Q5TGY1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TMCO4Q5TGY1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMCO4Q5TGY1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TMCO4Q5TGY1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMCO4Q5TGY1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMCO4Q5TGY1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMCO4Q5TGY1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMCO4Q5TGY1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMCO4Q5TGY1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMCO4Q5TGY1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TMCO4Q5TGY1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMCO4Q5TGY1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMCO4Q5TGY1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMCO4Q5TGY1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TMCO4Q5TGY1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMCO4Q5TGY1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMCO4Q5TGY1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMCO4Q5TGY1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMCO4Q5TGY1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMCO4Q5TGY1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMCO4Q5TGY1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMCO4Q5TGY1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMCO4Q5TGY1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMCO4Q5TGY1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMCO4Q5TGY1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMCO4Q5TGY1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMCO4Q5TGY1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMCO4Q5TGY1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMCO4Q5TGY1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMCO4Q5TGY1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMCO4Q5TGY1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TMCO4Q5TGY1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms