Protein–RNA interactions for Protein: Q5MAI5

CDKL4, Cyclin-dependent kinase-like 4, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL4Q5MAI5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDKL4Q5MAI5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDKL4Q5MAI5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDKL4Q5MAI5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDKL4Q5MAI5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDKL4Q5MAI5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDKL4Q5MAI5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDKL4Q5MAI5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDKL4Q5MAI5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDKL4Q5MAI5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDKL4Q5MAI5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDKL4Q5MAI5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDKL4Q5MAI5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDKL4Q5MAI5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CDKL4Q5MAI5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDKL4Q5MAI5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDKL4Q5MAI5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDKL4Q5MAI5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CDKL4Q5MAI5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDKL4Q5MAI5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDKL4Q5MAI5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDKL4Q5MAI5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDKL4Q5MAI5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDKL4Q5MAI5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDKL4Q5MAI5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDKL4Q5MAI5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDKL4Q5MAI5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDKL4Q5MAI5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDKL4Q5MAI5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDKL4Q5MAI5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDKL4Q5MAI5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDKL4Q5MAI5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDKL4Q5MAI5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDKL4Q5MAI5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDKL4Q5MAI5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDKL4Q5MAI5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDKL4Q5MAI5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDKL4Q5MAI5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDKL4Q5MAI5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDKL4Q5MAI5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDKL4Q5MAI5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDKL4Q5MAI5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDKL4Q5MAI5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDKL4Q5MAI5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDKL4Q5MAI5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDKL4Q5MAI5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CDKL4Q5MAI5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDKL4Q5MAI5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CDKL4Q5MAI5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDKL4Q5MAI5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CDKL4Q5MAI5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDKL4Q5MAI5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDKL4Q5MAI5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDKL4Q5MAI5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDKL4Q5MAI5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDKL4Q5MAI5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDKL4Q5MAI5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CDKL4Q5MAI5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDKL4Q5MAI5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDKL4Q5MAI5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDKL4Q5MAI5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDKL4Q5MAI5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDKL4Q5MAI5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDKL4Q5MAI5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CDKL4Q5MAI5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDKL4Q5MAI5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDKL4Q5MAI5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDKL4Q5MAI5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDKL4Q5MAI5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDKL4Q5MAI5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDKL4Q5MAI5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDKL4Q5MAI5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDKL4Q5MAI5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDKL4Q5MAI5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDKL4Q5MAI5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDKL4Q5MAI5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDKL4Q5MAI5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CDKL4Q5MAI5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDKL4Q5MAI5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CDKL4Q5MAI5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDKL4Q5MAI5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDKL4Q5MAI5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDKL4Q5MAI5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDKL4Q5MAI5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDKL4Q5MAI5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDKL4Q5MAI5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDKL4Q5MAI5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDKL4Q5MAI5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CDKL4Q5MAI5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDKL4Q5MAI5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDKL4Q5MAI5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDKL4Q5MAI5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDKL4Q5MAI5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDKL4Q5MAI5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDKL4Q5MAI5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDKL4Q5MAI5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDKL4Q5MAI5 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDKL4Q5MAI5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CDKL4Q5MAI5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDKL4Q5MAI5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms