Protein–RNA interactions for Protein: Q59EK9

RUNDC3A, RUN domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC3AQ59EK9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RUNDC3AQ59EK9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RUNDC3AQ59EK9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RUNDC3AQ59EK9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RUNDC3AQ59EK9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RUNDC3AQ59EK9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RUNDC3AQ59EK9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RUNDC3AQ59EK9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RUNDC3AQ59EK9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RUNDC3AQ59EK9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RUNDC3AQ59EK9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RUNDC3AQ59EK9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RUNDC3AQ59EK9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RUNDC3AQ59EK9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RUNDC3AQ59EK9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RUNDC3AQ59EK9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RUNDC3AQ59EK9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RUNDC3AQ59EK9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RUNDC3AQ59EK9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RUNDC3AQ59EK9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RUNDC3AQ59EK9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RUNDC3AQ59EK9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RUNDC3AQ59EK9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RUNDC3AQ59EK9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RUNDC3AQ59EK9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RUNDC3AQ59EK9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RUNDC3AQ59EK9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RUNDC3AQ59EK9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RUNDC3AQ59EK9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RUNDC3AQ59EK9 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RUNDC3AQ59EK9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RUNDC3AQ59EK9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RUNDC3AQ59EK9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RUNDC3AQ59EK9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RUNDC3AQ59EK9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RUNDC3AQ59EK9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RUNDC3AQ59EK9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RUNDC3AQ59EK9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RUNDC3AQ59EK9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RUNDC3AQ59EK9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RUNDC3AQ59EK9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RUNDC3AQ59EK9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RUNDC3AQ59EK9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RUNDC3AQ59EK9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RUNDC3AQ59EK9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RUNDC3AQ59EK9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RUNDC3AQ59EK9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RUNDC3AQ59EK9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RUNDC3AQ59EK9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RUNDC3AQ59EK9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RUNDC3AQ59EK9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RUNDC3AQ59EK9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RUNDC3AQ59EK9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RUNDC3AQ59EK9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RUNDC3AQ59EK9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RUNDC3AQ59EK9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RUNDC3AQ59EK9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RUNDC3AQ59EK9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RUNDC3AQ59EK9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RUNDC3AQ59EK9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RUNDC3AQ59EK9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RUNDC3AQ59EK9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RUNDC3AQ59EK9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RUNDC3AQ59EK9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RUNDC3AQ59EK9 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RUNDC3AQ59EK9 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RUNDC3AQ59EK9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RUNDC3AQ59EK9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RUNDC3AQ59EK9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RUNDC3AQ59EK9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RUNDC3AQ59EK9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RUNDC3AQ59EK9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RUNDC3AQ59EK9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RUNDC3AQ59EK9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RUNDC3AQ59EK9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RUNDC3AQ59EK9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RUNDC3AQ59EK9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RUNDC3AQ59EK9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RUNDC3AQ59EK9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RUNDC3AQ59EK9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RUNDC3AQ59EK9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RUNDC3AQ59EK9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RUNDC3AQ59EK9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RUNDC3AQ59EK9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RUNDC3AQ59EK9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RUNDC3AQ59EK9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RUNDC3AQ59EK9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RUNDC3AQ59EK9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RUNDC3AQ59EK9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RUNDC3AQ59EK9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RUNDC3AQ59EK9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RUNDC3AQ59EK9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RUNDC3AQ59EK9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RUNDC3AQ59EK9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RUNDC3AQ59EK9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RUNDC3AQ59EK9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RUNDC3AQ59EK9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RUNDC3AQ59EK9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RUNDC3AQ59EK9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RUNDC3AQ59EK9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms