Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HSD17B12Q53GQ0 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HSD17B12Q53GQ0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HSD17B12Q53GQ0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HSD17B12Q53GQ0 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HSD17B12Q53GQ0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HSD17B12Q53GQ0 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HSD17B12Q53GQ0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HSD17B12Q53GQ0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HSD17B12Q53GQ0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HSD17B12Q53GQ0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HSD17B12Q53GQ0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HSD17B12Q53GQ0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HSD17B12Q53GQ0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HSD17B12Q53GQ0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
HSD17B12Q53GQ0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
HSD17B12Q53GQ0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HSD17B12Q53GQ0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HSD17B12Q53GQ0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HSD17B12Q53GQ0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HSD17B12Q53GQ0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HSD17B12Q53GQ0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HSD17B12Q53GQ0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HSD17B12Q53GQ0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HSD17B12Q53GQ0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HSD17B12Q53GQ0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
HSD17B12Q53GQ0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HSD17B12Q53GQ0 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HSD17B12Q53GQ0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HSD17B12Q53GQ0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
HSD17B12Q53GQ0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
HSD17B12Q53GQ0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
HSD17B12Q53GQ0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
HSD17B12Q53GQ0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HSD17B12Q53GQ0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HSD17B12Q53GQ0 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HSD17B12Q53GQ0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HSD17B12Q53GQ0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HSD17B12Q53GQ0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HSD17B12Q53GQ0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HSD17B12Q53GQ0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HSD17B12Q53GQ0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
HSD17B12Q53GQ0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HSD17B12Q53GQ0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HSD17B12Q53GQ0 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HSD17B12Q53GQ0 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HSD17B12Q53GQ0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
HSD17B12Q53GQ0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HSD17B12Q53GQ0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HSD17B12Q53GQ0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HSD17B12Q53GQ0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HSD17B12Q53GQ0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HSD17B12Q53GQ0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HSD17B12Q53GQ0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HSD17B12Q53GQ0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HSD17B12Q53GQ0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HSD17B12Q53GQ0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HSD17B12Q53GQ0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HSD17B12Q53GQ0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HSD17B12Q53GQ0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HSD17B12Q53GQ0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HSD17B12Q53GQ0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HSD17B12Q53GQ0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HSD17B12Q53GQ0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HSD17B12Q53GQ0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
HSD17B12Q53GQ0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HSD17B12Q53GQ0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HSD17B12Q53GQ0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HSD17B12Q53GQ0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
HSD17B12Q53GQ0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HSD17B12Q53GQ0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HSD17B12Q53GQ0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
HSD17B12Q53GQ0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HSD17B12Q53GQ0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HSD17B12Q53GQ0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HSD17B12Q53GQ0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HSD17B12Q53GQ0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HSD17B12Q53GQ0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
HSD17B12Q53GQ0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HSD17B12Q53GQ0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HSD17B12Q53GQ0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HSD17B12Q53GQ0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HSD17B12Q53GQ0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HSD17B12Q53GQ0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HSD17B12Q53GQ0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HSD17B12Q53GQ0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HSD17B12Q53GQ0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HSD17B12Q53GQ0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HSD17B12Q53GQ0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HSD17B12Q53GQ0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HSD17B12Q53GQ0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HSD17B12Q53GQ0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HSD17B12Q53GQ0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HSD17B12Q53GQ0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HSD17B12Q53GQ0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HSD17B12Q53GQ0 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HSD17B12Q53GQ0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HSD17B12Q53GQ0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HSD17B12Q53GQ0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HSD17B12Q53GQ0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 306 ms