Protein–RNA interactions for Protein: Q2YD98

UVSSA, UV-stimulated scaffold protein A, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UVSSAQ2YD98 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
UVSSAQ2YD98 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
UVSSAQ2YD98 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
UVSSAQ2YD98 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
UVSSAQ2YD98 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
UVSSAQ2YD98 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
UVSSAQ2YD98 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
UVSSAQ2YD98 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
UVSSAQ2YD98 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
UVSSAQ2YD98 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
UVSSAQ2YD98 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
UVSSAQ2YD98 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
UVSSAQ2YD98 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
UVSSAQ2YD98 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
UVSSAQ2YD98 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
UVSSAQ2YD98 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
UVSSAQ2YD98 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
UVSSAQ2YD98 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
UVSSAQ2YD98 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
UVSSAQ2YD98 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
UVSSAQ2YD98 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
UVSSAQ2YD98 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
UVSSAQ2YD98 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
UVSSAQ2YD98 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
UVSSAQ2YD98 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
UVSSAQ2YD98 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
UVSSAQ2YD98 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
UVSSAQ2YD98 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
UVSSAQ2YD98 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
UVSSAQ2YD98 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
UVSSAQ2YD98 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
UVSSAQ2YD98 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
UVSSAQ2YD98 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
UVSSAQ2YD98 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
UVSSAQ2YD98 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
UVSSAQ2YD98 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
UVSSAQ2YD98 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
UVSSAQ2YD98 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
UVSSAQ2YD98 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
UVSSAQ2YD98 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
UVSSAQ2YD98 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
UVSSAQ2YD98 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
UVSSAQ2YD98 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
UVSSAQ2YD98 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
UVSSAQ2YD98 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
UVSSAQ2YD98 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
UVSSAQ2YD98 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
UVSSAQ2YD98 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
UVSSAQ2YD98 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
UVSSAQ2YD98 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
UVSSAQ2YD98 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
UVSSAQ2YD98 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
UVSSAQ2YD98 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
UVSSAQ2YD98 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
UVSSAQ2YD98 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
UVSSAQ2YD98 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
UVSSAQ2YD98 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
UVSSAQ2YD98 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
UVSSAQ2YD98 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
UVSSAQ2YD98 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
UVSSAQ2YD98 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
UVSSAQ2YD98 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
UVSSAQ2YD98 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
UVSSAQ2YD98 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
UVSSAQ2YD98 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
UVSSAQ2YD98 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
UVSSAQ2YD98 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
UVSSAQ2YD98 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
UVSSAQ2YD98 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
UVSSAQ2YD98 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
UVSSAQ2YD98 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
UVSSAQ2YD98 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
UVSSAQ2YD98 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
UVSSAQ2YD98 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
UVSSAQ2YD98 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
UVSSAQ2YD98 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
UVSSAQ2YD98 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
UVSSAQ2YD98 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
UVSSAQ2YD98 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
UVSSAQ2YD98 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
UVSSAQ2YD98 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
UVSSAQ2YD98 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
UVSSAQ2YD98 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
UVSSAQ2YD98 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
UVSSAQ2YD98 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
UVSSAQ2YD98 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
UVSSAQ2YD98 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
UVSSAQ2YD98 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
UVSSAQ2YD98 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
UVSSAQ2YD98 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
UVSSAQ2YD98 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
UVSSAQ2YD98 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
UVSSAQ2YD98 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
UVSSAQ2YD98 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
UVSSAQ2YD98 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
UVSSAQ2YD98 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
UVSSAQ2YD98 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
UVSSAQ2YD98 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
UVSSAQ2YD98 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
UVSSAQ2YD98 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.9 ms