Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAL6

VWC2, Brorin, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWC2Q2TAL6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VWC2Q2TAL6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VWC2Q2TAL6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VWC2Q2TAL6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VWC2Q2TAL6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VWC2Q2TAL6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
VWC2Q2TAL6 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VWC2Q2TAL6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VWC2Q2TAL6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VWC2Q2TAL6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VWC2Q2TAL6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VWC2Q2TAL6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VWC2Q2TAL6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
VWC2Q2TAL6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VWC2Q2TAL6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VWC2Q2TAL6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VWC2Q2TAL6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VWC2Q2TAL6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VWC2Q2TAL6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VWC2Q2TAL6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VWC2Q2TAL6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VWC2Q2TAL6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VWC2Q2TAL6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
VWC2Q2TAL6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VWC2Q2TAL6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
VWC2Q2TAL6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
VWC2Q2TAL6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
VWC2Q2TAL6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VWC2Q2TAL6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VWC2Q2TAL6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VWC2Q2TAL6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VWC2Q2TAL6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VWC2Q2TAL6 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
VWC2Q2TAL6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VWC2Q2TAL6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VWC2Q2TAL6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VWC2Q2TAL6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VWC2Q2TAL6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VWC2Q2TAL6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
VWC2Q2TAL6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
VWC2Q2TAL6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
VWC2Q2TAL6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
VWC2Q2TAL6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VWC2Q2TAL6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
VWC2Q2TAL6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VWC2Q2TAL6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VWC2Q2TAL6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
VWC2Q2TAL6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VWC2Q2TAL6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VWC2Q2TAL6 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VWC2Q2TAL6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
VWC2Q2TAL6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
VWC2Q2TAL6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
VWC2Q2TAL6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
VWC2Q2TAL6 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VWC2Q2TAL6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
VWC2Q2TAL6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VWC2Q2TAL6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VWC2Q2TAL6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
VWC2Q2TAL6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
VWC2Q2TAL6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
VWC2Q2TAL6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
VWC2Q2TAL6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
VWC2Q2TAL6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VWC2Q2TAL6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VWC2Q2TAL6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VWC2Q2TAL6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VWC2Q2TAL6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VWC2Q2TAL6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VWC2Q2TAL6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
VWC2Q2TAL6 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
VWC2Q2TAL6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VWC2Q2TAL6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
VWC2Q2TAL6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
VWC2Q2TAL6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VWC2Q2TAL6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VWC2Q2TAL6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VWC2Q2TAL6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VWC2Q2TAL6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VWC2Q2TAL6 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VWC2Q2TAL6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VWC2Q2TAL6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VWC2Q2TAL6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VWC2Q2TAL6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
VWC2Q2TAL6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VWC2Q2TAL6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VWC2Q2TAL6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VWC2Q2TAL6 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VWC2Q2TAL6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VWC2Q2TAL6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VWC2Q2TAL6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
VWC2Q2TAL6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VWC2Q2TAL6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
VWC2Q2TAL6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VWC2Q2TAL6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
VWC2Q2TAL6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
VWC2Q2TAL6 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
VWC2Q2TAL6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
VWC2Q2TAL6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VWC2Q2TAL6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms