Protein–RNA interactions for Protein: Q2NL98

VMAC, Vimentin-type intermediate filament-associated coiled-coil protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VMACQ2NL98 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VMACQ2NL98 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VMACQ2NL98 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VMACQ2NL98 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VMACQ2NL98 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VMACQ2NL98 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VMACQ2NL98 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VMACQ2NL98 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VMACQ2NL98 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VMACQ2NL98 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VMACQ2NL98 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VMACQ2NL98 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VMACQ2NL98 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VMACQ2NL98 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VMACQ2NL98 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VMACQ2NL98 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VMACQ2NL98 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VMACQ2NL98 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VMACQ2NL98 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VMACQ2NL98 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VMACQ2NL98 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VMACQ2NL98 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VMACQ2NL98 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VMACQ2NL98 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VMACQ2NL98 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VMACQ2NL98 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VMACQ2NL98 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VMACQ2NL98 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VMACQ2NL98 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VMACQ2NL98 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VMACQ2NL98 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VMACQ2NL98 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VMACQ2NL98 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
VMACQ2NL98 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VMACQ2NL98 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VMACQ2NL98 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VMACQ2NL98 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VMACQ2NL98 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VMACQ2NL98 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VMACQ2NL98 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VMACQ2NL98 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VMACQ2NL98 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VMACQ2NL98 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VMACQ2NL98 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VMACQ2NL98 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VMACQ2NL98 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
VMACQ2NL98 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VMACQ2NL98 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VMACQ2NL98 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VMACQ2NL98 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VMACQ2NL98 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VMACQ2NL98 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VMACQ2NL98 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VMACQ2NL98 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VMACQ2NL98 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VMACQ2NL98 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
VMACQ2NL98 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VMACQ2NL98 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
VMACQ2NL98 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VMACQ2NL98 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VMACQ2NL98 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VMACQ2NL98 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VMACQ2NL98 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VMACQ2NL98 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VMACQ2NL98 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
VMACQ2NL98 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VMACQ2NL98 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VMACQ2NL98 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VMACQ2NL98 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VMACQ2NL98 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VMACQ2NL98 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VMACQ2NL98 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VMACQ2NL98 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VMACQ2NL98 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VMACQ2NL98 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VMACQ2NL98 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
VMACQ2NL98 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VMACQ2NL98 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VMACQ2NL98 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VMACQ2NL98 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VMACQ2NL98 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VMACQ2NL98 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VMACQ2NL98 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VMACQ2NL98 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VMACQ2NL98 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VMACQ2NL98 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VMACQ2NL98 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VMACQ2NL98 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VMACQ2NL98 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VMACQ2NL98 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VMACQ2NL98 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
VMACQ2NL98 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VMACQ2NL98 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
VMACQ2NL98 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VMACQ2NL98 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VMACQ2NL98 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VMACQ2NL98 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VMACQ2NL98 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VMACQ2NL98 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VMACQ2NL98 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms