Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNAPC1Q16533 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SNAPC1Q16533 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SNAPC1Q16533 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SNAPC1Q16533 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SNAPC1Q16533 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SNAPC1Q16533 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SNAPC1Q16533 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SNAPC1Q16533 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SNAPC1Q16533 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SNAPC1Q16533 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNAPC1Q16533 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SNAPC1Q16533 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
SNAPC1Q16533 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNAPC1Q16533 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNAPC1Q16533 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SNAPC1Q16533 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNAPC1Q16533 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNAPC1Q16533 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNAPC1Q16533 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNAPC1Q16533 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNAPC1Q16533 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNAPC1Q16533 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNAPC1Q16533 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNAPC1Q16533 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SNAPC1Q16533 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNAPC1Q16533 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNAPC1Q16533 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNAPC1Q16533 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNAPC1Q16533 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNAPC1Q16533 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNAPC1Q16533 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNAPC1Q16533 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNAPC1Q16533 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNAPC1Q16533 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNAPC1Q16533 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNAPC1Q16533 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNAPC1Q16533 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNAPC1Q16533 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNAPC1Q16533 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNAPC1Q16533 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNAPC1Q16533 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNAPC1Q16533 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNAPC1Q16533 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNAPC1Q16533 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNAPC1Q16533 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNAPC1Q16533 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNAPC1Q16533 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNAPC1Q16533 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNAPC1Q16533 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNAPC1Q16533 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNAPC1Q16533 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNAPC1Q16533 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNAPC1Q16533 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNAPC1Q16533 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNAPC1Q16533 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNAPC1Q16533 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNAPC1Q16533 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNAPC1Q16533 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNAPC1Q16533 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNAPC1Q16533 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNAPC1Q16533 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNAPC1Q16533 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNAPC1Q16533 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNAPC1Q16533 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNAPC1Q16533 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNAPC1Q16533 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNAPC1Q16533 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNAPC1Q16533 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNAPC1Q16533 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNAPC1Q16533 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNAPC1Q16533 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNAPC1Q16533 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNAPC1Q16533 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNAPC1Q16533 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNAPC1Q16533 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNAPC1Q16533 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SNAPC1Q16533 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SNAPC1Q16533 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SNAPC1Q16533 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNAPC1Q16533 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNAPC1Q16533 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNAPC1Q16533 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNAPC1Q16533 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNAPC1Q16533 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNAPC1Q16533 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNAPC1Q16533 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNAPC1Q16533 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNAPC1Q16533 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNAPC1Q16533 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNAPC1Q16533 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNAPC1Q16533 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNAPC1Q16533 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SNAPC1Q16533 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNAPC1Q16533 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNAPC1Q16533 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNAPC1Q16533 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNAPC1Q16533 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNAPC1Q16533 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SNAPC1Q16533 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
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