Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CYTH1Q15438 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CYTH1Q15438 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CYTH1Q15438 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CYTH1Q15438 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CYTH1Q15438 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CYTH1Q15438 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CYTH1Q15438 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CYTH1Q15438 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CYTH1Q15438 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CYTH1Q15438 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CYTH1Q15438 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CYTH1Q15438 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CYTH1Q15438 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CYTH1Q15438 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CYTH1Q15438 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CYTH1Q15438 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CYTH1Q15438 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CYTH1Q15438 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CYTH1Q15438 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CYTH1Q15438 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CYTH1Q15438 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CYTH1Q15438 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CYTH1Q15438 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CYTH1Q15438 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CYTH1Q15438 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CYTH1Q15438 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CYTH1Q15438 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CYTH1Q15438 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CYTH1Q15438 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CYTH1Q15438 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CYTH1Q15438 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CYTH1Q15438 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CYTH1Q15438 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CYTH1Q15438 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CYTH1Q15438 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CYTH1Q15438 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CYTH1Q15438 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CYTH1Q15438 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CYTH1Q15438 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CYTH1Q15438 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CYTH1Q15438 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CYTH1Q15438 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CYTH1Q15438 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CYTH1Q15438 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CYTH1Q15438 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CYTH1Q15438 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CYTH1Q15438 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CYTH1Q15438 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CYTH1Q15438 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CYTH1Q15438 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CYTH1Q15438 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CYTH1Q15438 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CYTH1Q15438 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CYTH1Q15438 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CYTH1Q15438 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CYTH1Q15438 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CYTH1Q15438 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYTH1Q15438 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CYTH1Q15438 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYTH1Q15438 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYTH1Q15438 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYTH1Q15438 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CYTH1Q15438 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CYTH1Q15438 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CYTH1Q15438 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CYTH1Q15438 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CYTH1Q15438 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CYTH1Q15438 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CYTH1Q15438 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CYTH1Q15438 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CYTH1Q15438 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CYTH1Q15438 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CYTH1Q15438 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CYTH1Q15438 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CYTH1Q15438 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CYTH1Q15438 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CYTH1Q15438 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CYTH1Q15438 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CYTH1Q15438 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CYTH1Q15438 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CYTH1Q15438 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CYTH1Q15438 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CYTH1Q15438 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CYTH1Q15438 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CYTH1Q15438 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CYTH1Q15438 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CYTH1Q15438 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CYTH1Q15438 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CYTH1Q15438 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CYTH1Q15438 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CYTH1Q15438 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CYTH1Q15438 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CYTH1Q15438 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CYTH1Q15438 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CYTH1Q15438 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CYTH1Q15438 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CYTH1Q15438 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CYTH1Q15438 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CYTH1Q15438 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms