Protein–RNA interactions for Protein: Q15327

ANKRD1, Ankyrin repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD1Q15327 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ANKRD1Q15327 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ANKRD1Q15327 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ANKRD1Q15327 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ANKRD1Q15327 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ANKRD1Q15327 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ANKRD1Q15327 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
ANKRD1Q15327 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ANKRD1Q15327 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ANKRD1Q15327 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ANKRD1Q15327 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ANKRD1Q15327 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
ANKRD1Q15327 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ANKRD1Q15327 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ANKRD1Q15327 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ANKRD1Q15327 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ANKRD1Q15327 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
ANKRD1Q15327 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ANKRD1Q15327 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ANKRD1Q15327 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ANKRD1Q15327 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ANKRD1Q15327 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ANKRD1Q15327 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ANKRD1Q15327 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ANKRD1Q15327 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ANKRD1Q15327 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
ANKRD1Q15327 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ANKRD1Q15327 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ANKRD1Q15327 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ANKRD1Q15327 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ANKRD1Q15327 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ANKRD1Q15327 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
ANKRD1Q15327 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ANKRD1Q15327 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ANKRD1Q15327 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ANKRD1Q15327 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ANKRD1Q15327 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ANKRD1Q15327 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ANKRD1Q15327 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
ANKRD1Q15327 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ANKRD1Q15327 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ANKRD1Q15327 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ANKRD1Q15327 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ANKRD1Q15327 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ANKRD1Q15327 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ANKRD1Q15327 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ANKRD1Q15327 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ANKRD1Q15327 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ANKRD1Q15327 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ANKRD1Q15327 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ANKRD1Q15327 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
ANKRD1Q15327 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ANKRD1Q15327 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ANKRD1Q15327 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ANKRD1Q15327 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ANKRD1Q15327 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ANKRD1Q15327 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ANKRD1Q15327 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ANKRD1Q15327 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ANKRD1Q15327 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ANKRD1Q15327 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ANKRD1Q15327 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ANKRD1Q15327 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ANKRD1Q15327 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ANKRD1Q15327 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
ANKRD1Q15327 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ANKRD1Q15327 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ANKRD1Q15327 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ANKRD1Q15327 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ANKRD1Q15327 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ANKRD1Q15327 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ANKRD1Q15327 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ANKRD1Q15327 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ANKRD1Q15327 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ANKRD1Q15327 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ANKRD1Q15327 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ANKRD1Q15327 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ANKRD1Q15327 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ANKRD1Q15327 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ANKRD1Q15327 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ANKRD1Q15327 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ANKRD1Q15327 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ANKRD1Q15327 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ANKRD1Q15327 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ANKRD1Q15327 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ANKRD1Q15327 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ANKRD1Q15327 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ANKRD1Q15327 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ANKRD1Q15327 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ANKRD1Q15327 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ANKRD1Q15327 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ANKRD1Q15327 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ANKRD1Q15327 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ANKRD1Q15327 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ANKRD1Q15327 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ANKRD1Q15327 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ANKRD1Q15327 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ANKRD1Q15327 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ANKRD1Q15327 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
ANKRD1Q15327 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms