Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB39AQ14964 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB39AQ14964 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB39AQ14964 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB39AQ14964 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB39AQ14964 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB39AQ14964 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB39AQ14964 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB39AQ14964 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB39AQ14964 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB39AQ14964 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB39AQ14964 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB39AQ14964 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB39AQ14964 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB39AQ14964 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB39AQ14964 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB39AQ14964 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB39AQ14964 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB39AQ14964 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB39AQ14964 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB39AQ14964 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB39AQ14964 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB39AQ14964 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB39AQ14964 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB39AQ14964 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB39AQ14964 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB39AQ14964 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB39AQ14964 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB39AQ14964 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB39AQ14964 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB39AQ14964 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB39AQ14964 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB39AQ14964 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB39AQ14964 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB39AQ14964 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB39AQ14964 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB39AQ14964 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB39AQ14964 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB39AQ14964 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB39AQ14964 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB39AQ14964 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB39AQ14964 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB39AQ14964 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB39AQ14964 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RAB39AQ14964 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB39AQ14964 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB39AQ14964 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB39AQ14964 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB39AQ14964 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB39AQ14964 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB39AQ14964 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB39AQ14964 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB39AQ14964 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB39AQ14964 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB39AQ14964 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB39AQ14964 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB39AQ14964 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB39AQ14964 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB39AQ14964 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB39AQ14964 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB39AQ14964 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB39AQ14964 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB39AQ14964 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB39AQ14964 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB39AQ14964 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB39AQ14964 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB39AQ14964 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB39AQ14964 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB39AQ14964 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB39AQ14964 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB39AQ14964 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB39AQ14964 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB39AQ14964 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB39AQ14964 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB39AQ14964 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB39AQ14964 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB39AQ14964 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB39AQ14964 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB39AQ14964 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB39AQ14964 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB39AQ14964 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB39AQ14964 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB39AQ14964 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB39AQ14964 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB39AQ14964 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB39AQ14964 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB39AQ14964 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB39AQ14964 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB39AQ14964 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB39AQ14964 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB39AQ14964 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB39AQ14964 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB39AQ14964 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB39AQ14964 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB39AQ14964 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB39AQ14964 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB39AQ14964 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAB39AQ14964 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAB39AQ14964 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB39AQ14964 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
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