Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIK2Q13002 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIK2Q13002 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIK2Q13002 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIK2Q13002 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIK2Q13002 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIK2Q13002 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIK2Q13002 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIK2Q13002 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIK2Q13002 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIK2Q13002 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRIK2Q13002 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRIK2Q13002 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRIK2Q13002 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRIK2Q13002 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRIK2Q13002 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRIK2Q13002 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRIK2Q13002 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRIK2Q13002 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRIK2Q13002 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRIK2Q13002 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRIK2Q13002 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRIK2Q13002 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRIK2Q13002 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRIK2Q13002 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
GRIK2Q13002 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GRIK2Q13002 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GRIK2Q13002 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GRIK2Q13002 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GRIK2Q13002 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GRIK2Q13002 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GRIK2Q13002 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GRIK2Q13002 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRIK2Q13002 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRIK2Q13002 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRIK2Q13002 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRIK2Q13002 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRIK2Q13002 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRIK2Q13002 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRIK2Q13002 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRIK2Q13002 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRIK2Q13002 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRIK2Q13002 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRIK2Q13002 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRIK2Q13002 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRIK2Q13002 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRIK2Q13002 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRIK2Q13002 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRIK2Q13002 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRIK2Q13002 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRIK2Q13002 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRIK2Q13002 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRIK2Q13002 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIK2Q13002 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIK2Q13002 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIK2Q13002 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIK2Q13002 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIK2Q13002 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIK2Q13002 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIK2Q13002 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIK2Q13002 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIK2Q13002 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRIK2Q13002 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
GRIK2Q13002 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRIK2Q13002 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRIK2Q13002 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRIK2Q13002 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GRIK2Q13002 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
GRIK2Q13002 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GRIK2Q13002 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
GRIK2Q13002 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRIK2Q13002 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRIK2Q13002 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRIK2Q13002 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRIK2Q13002 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRIK2Q13002 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRIK2Q13002 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRIK2Q13002 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRIK2Q13002 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRIK2Q13002 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRIK2Q13002 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRIK2Q13002 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRIK2Q13002 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRIK2Q13002 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
GRIK2Q13002 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRIK2Q13002 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRIK2Q13002 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
GRIK2Q13002 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRIK2Q13002 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRIK2Q13002 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRIK2Q13002 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRIK2Q13002 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRIK2Q13002 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRIK2Q13002 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
GRIK2Q13002 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRIK2Q13002 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRIK2Q13002 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIK2Q13002 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIK2Q13002 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIK2Q13002 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
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